RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 HGH1Q9BTY7 390 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 ZBTB26Q9HCK0 441 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 EPS15L1Q9UBC2 864 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 CD84Q9UIB8 345 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 DENND4AQ7Z401 1863 aa15.99■□□□□ 0.15
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HPS1-202ENST00000338546 MAPK9P45984 424 aa15.99■□□□□ 0.15
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HPS1-202ENST00000338546 SPINT1O43278 529 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
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HPS1-202ENST00000338546 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
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HPS1-202ENST00000338546 TWIST2Q8WVJ9 160 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 ASZ1Q8WWH4 475 aa15.98■□□□□ 0.15
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HPS1-202ENST00000338546 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 NDE1Q9NXR1 346 aa15.98■□□□□ 0.15
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HPS1-202ENST00000338546 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 MYO9BQ13459 2157 aa15.97■□□□□ 0.15
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HPS1-202ENST00000338546 KCNV2Q8TDN2 545 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 CHFRQ96EP1 664 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 CATSPER2Q96P56 530 aa15.97■□□□□ 0.15
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HPS1-202ENST00000338546 AP1G1O43747 822 aa15.96■□□□□ 0.15
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HPS1-202ENST00000338546 ACADVLP49748 655 aa15.96■□□□□ 0.15
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HPS1-202ENST00000338546 ASB11Q8WXH4 323 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 RHBDF1Q96CC6 855 aa15.96■□□□□ 0.15
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HPS1-202ENST00000338546 PPP1R36Q96LQ0 422 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 CD244Q9BZW8 370 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 ZNF576Q9H609 170 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 STON1Q9Y6Q2 735 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 ANHXE9PGG2 379 aa15.96■□□□□ 0.14
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