RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 GSTT2P0CG29 244 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 GSTT2BP0CG30 244 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 PORP16435 677 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 PCSK6P29122 969 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 GKP32189 559 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 RHOAP61586 193 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 ERVK-8P63133 956 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 NANOGP8Q6NSW7 305 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 FAM151BQ6UXP7 276 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 CAMK1DQ8IU85 385 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM199Q8N511 208 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 RAET1EQ8TD07 263 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 MYRFLQ96LU7 910 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 TRIM54Q9BYV2 358 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 GPR63Q9BZJ6 419 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 BRINP2Q9C0B6 783 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 P2RY12Q9H244 342 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 CWH43Q9H720 699 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 NANOGQ9H9S0 305 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 OAZ3Q9UMX2 235 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 EEDO75530 441 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 CLIC3O95833 236 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 PTGER3P43115 390 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 CLCN4P51793 760 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 IL27RAQ6UWB1 636 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 CLDN19Q8N6F1 224 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 TRIML2Q8N7C3 387 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 PDZD8Q8NEN9 1154 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 METTL6Q8TCB7 284 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 FEM1AQ9BSK4 669 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 ANKRD60Q9BZ19 345 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 TRIM15Q9C019 465 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa16.14■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 A8MX80 341 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 GUCA1CO95843 209 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 FASP25445 335 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 RXRGP48443 463 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 ZXDBP98169 803 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 COQ5Q5HYK3 327 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 C6orf183Q5T699 404 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 KIAA1841Q6NSI8 718 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 SEPT8Q92599 483 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 CLIP3Q96DZ5 547 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 ZMYM5Q9UJ78 669 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 MYRFQ9Y2G1 1151 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 PKP3Q9Y446 797 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 TCRBV5S2A0A599 114 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 OR7A17O14581 309 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 ESR1P03372 595 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 INHAP05111 366 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 PSMD7P51665 324 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 TAF12Q16514 161 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 SBSNQ6UWP8 590 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 LRRC43Q8N309 656 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 FIBCD1Q8N539 461 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 OR4F6Q8NGB9 312 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 DDI1Q8WTU0 396 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF382Q96SR6 550 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 SEPHS2Q99611 448 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM175Q9BSA9 504 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 CIPCQ9C0C6 399 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 PNPLA3Q9NST1 481 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 VPS51Q9UID3 782 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 COMMD10Q9Y6G5 202 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 CEPT1Q9Y6K0 416 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa16.13■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 H7C0S8 307 aa16.12■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 PFDN6O15212 129 aa16.12■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 ALDH1A1P00352 501 aa16.12■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 G6PDP11413 515 aa16.12■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 PIK3CGP48736 1102 aa16.12■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 CCT8P50990 548 aa16.12■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 DGKQP52824 942 aa16.12■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 FOXM1Q08050 763 aa16.12■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 SMUG1Q53HV7 270 aa16.12■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa16.12■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 FRA10AC1Q70Z53 315 aa16.12■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa16.12■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 TRPV3Q8NET8 790 aa16.12■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 DMTF1Q9Y222 760 aa16.12■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 DHRS7Q9Y394 339 aa16.12■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 PRSS21Q9Y6M0 314 aa16.12■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 GOLGA8CPA6NN73 597 aa16.12■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 ACOX3O15254 700 aa16.12■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms