RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 DUX4L2P0CJ85 424 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 DUX4L3P0CJ86 424 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 DUX4L4P0CJ87 422 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 DUX4L5P0CJ88 424 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 DUX4L6P0CJ89 424 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 DUX4L7P0CJ90 424 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 SLC35E2BP0CK96 405 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 HRH2P25021 359 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 GRIA1P42261 906 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 ERFP50548 548 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 TSC22D1Q15714 1073 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 TECRLQ5HYJ1 363 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 P3H2Q8IVL5 708 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 AQP12AQ8IXF9 295 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 LPGAT1Q92604 370 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 VPS33AQ96AX1 596 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM209Q96SK2 561 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 NMUR2Q9GZQ4 415 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 POMKQ9H5K3 350 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 CAAP1Q9H8G2 361 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 DUX4Q9UBX2 424 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 GSAPA4D1B5 854 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 MROH6A6NGR9 719 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 UPK3BL1B0FP48 263 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 UPK3BL2E5RIL1 263 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 AIM2O14862 343 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 DLX3O60479 287 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 CSF2RAP15509 400 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 GCAP28676 217 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 MTM1Q13496 603 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 GNA13Q14344 377 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 RNF165Q6ZSG1 346 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 FRMD7Q6ZUT3 714 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 DENND6AQ8IWF6 608 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 MIPEPQ99797 713 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 ATAD3AQ9NVI7 634 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 TAS2R1Q9NYW7 299 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 RLFQ13129 1914 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 LEFTY2O00292 366 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 PRAMEF1O95521 474 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 GOT2P00505 430 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 HIST1H2ABP04908 130 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 PPP2R1BP30154 601 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 VIPR1P32241 457 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 RFX4Q33E94 735 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 IRGCQ6NXR0 463 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 ERICH5Q6P6B1 374 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 ZBTB2Q8N680 514 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 ADCY4Q8NFM4 1077 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 OR10G6Q8NH81 332 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 HIST1H2ACQ93077 130 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 TBCDQ9BTW9 1192 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 SMOXQ9NWM0 555 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 A8MT66 165 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 TOR1BO14657 336 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 UGDHO60701 494 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 PDHA1P08559 390 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 UQCRBP14927 111 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 CREB1P16220 341 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 MILR1Q7Z6M3 343 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 CMTM8Q8IZV2 173 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 PACRGLQ8N7B6 248 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 ZFP14Q9HCL3 533 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 MID1IP1Q9NPA3 183 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 SPHK2Q9NRA0 654 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 DNAJC11Q9NVH1 559 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 KLHL28Q9NXS3 571 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 BLOC1S6Q9UL45 172 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 WASH3PC4AMC7 463 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 H0YJX3 145 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 ATF6P18850 670 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 TEAD1P28347 426 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 PIK3CBP42338 1070 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 NUDT2P50583 147 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 BIKQ13323 160 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 SPIDRQ14159 915 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 ACOX2Q99424 681 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPN3-201ENST00000262539 OR10H2O60403 315 aa8.12□□□□□ -1.11
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