RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 CA7P43166 264 aa16■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ADORA2A-AS1P86434 159 aa16■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 CDSNQ15517 529 aa16■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 INSCQ1MX18 579 aa16■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa16■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 FKBP15Q5T1M5 1219 aa16■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 AGAP9Q5VTM2 703 aa16■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 XKRXQ6PP77 449 aa16■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 CRTC3Q6UUV7 619 aa16■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 WASH2PQ6VEQ5 465 aa16■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 C3orf20Q8ND61 904 aa16■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 GPR150Q8NGU9 434 aa16■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 CHTF18Q8WVB6 975 aa16■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 CNDP1Q96KN2 507 aa16■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 OR2AG1Q9H205 316 aa16■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ARFGAP3Q9NP61 516 aa16■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa16■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 GTF3C1Q12789 2109 aa16■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 C9J4A7 227 aa15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 PEX12O00623 359 aa15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 LDB2O43679 373 aa15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 KRT3P12035 628 aa15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 NSFP46459 744 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 DRG2P55039 364 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 MAXP61244 160 aa15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 PLCL1Q15111 1095 aa15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ASIC2Q16515 512 aa15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 RALGPS1Q5JS13 557 aa15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC183Q5T5S1 534 aa15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 WDR59Q6PJI9 974 aa15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 CEP97Q8IW35 865 aa15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 GBP5Q96PP8 586 aa15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 SPOCK3Q9BQ16 436 aa15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 TIMM29Q9BSF4 260 aa15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 TLR10Q9BXR5 811 aa15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 HSD3B7Q9H2F3 369 aa15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ADAM22Q9P0K1 906 aa15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ATRQ13535 2644 aa15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC78A2IDD5 438 aa15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 OR5K3A6NET4 321 aa15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 GPR89AB7ZAQ6 455 aa15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 CLDN7O95471 211 aa15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 GPR89BP0CG08 455 aa15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 AGAP20933 346 aa15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 Q0VFX4 171 aa15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 TLR1Q15399 786 aa15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 TMTC4Q5T4D3 741 aa15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 KLHL35Q6PF15 583 aa15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 TTC30BQ8N4P2 665 aa15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 OR1L3Q8NH93 324 aa15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 NR4A3Q92570 626 aa15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ERGIC2Q96RQ1 377 aa15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 SELENOOQ9BVL4 669 aa15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 WDR37Q9Y2I8 494 aa15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 SIGLEC16A6NMB1 481 aa15.97■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 CALB1P05937 261 aa15.97■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 TPM2P07951 284 aa15.97■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ERCC2P18074 760 aa15.97■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 IL4RP24394 825 aa15.97■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 SPINT3P49223 89 aa15.97■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 MYL5Q02045 173 aa15.97■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa15.97■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 GFRALQ6UXV0 394 aa15.97■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa15.97■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF547Q8IVP9 402 aa15.97■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFAF2Q8N183 169 aa15.97■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 CARFQ8N187 725 aa15.97■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 NEK11Q8NG66 645 aa15.97■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 PPM1MQ96MI6 270 aa15.97■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 TAAR6Q96RI8 345 aa15.97■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 SYT11Q9BT88 431 aa15.97■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 FANCEQ9HB96 536 aa15.97■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 SOHLH2Q9NX45 425 aa15.97■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 DTLQ9NZJ0 730 aa15.97■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 HCFC1P51610 2035 aa15.97■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.3 ms