RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223864.6

PLGRKT-201, Transcript of plasminogen receptor with a C-terminal lysine, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLGRKT, Length 932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLGRKT-201ENST00000223864 VIPP01282 170 aa16.9■□□□□ 0.3
PLGRKT-201ENST00000223864 BRAFP15056 766 aa16.9■□□□□ 0.3
PLGRKT-201ENST00000223864 MSH3P20585 1137 aa16.9■□□□□ 0.3
PLGRKT-201ENST00000223864 RPL10P27635 214 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
PLGRKT-201ENST00000223864 HADHAP40939 763 aa16.9■□□□□ 0.3
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
PLGRKT-201ENST00000223864 CTSCP53634 463 aa16.9■□□□□ 0.3
PLGRKT-201ENST00000223864 MAPK10P53779 464 aa16.9■□□□□ 0.3
PLGRKT-201ENST00000223864 DMPKQ09013 629 aa16.9■□□□□ 0.3
PLGRKT-201ENST00000223864 OASLQ15646 514 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
PLGRKT-201ENST00000223864 LONRF2Q1L5Z9 754 aa16.9■□□□□ 0.3
PLGRKT-201ENST00000223864 TMEM220Q6QAJ8 160 aa16.9■□□□□ 0.3
PLGRKT-201ENST00000223864 TRIM48Q8IWZ4 208 aa16.9■□□□□ 0.3
PLGRKT-201ENST00000223864 DEPDC4Q8N2C3 294 aa16.9■□□□□ 0.3
PLGRKT-201ENST00000223864 AGBL5Q8NDL9 886 aa16.9■□□□□ 0.3
PLGRKT-201ENST00000223864 OR13C4Q8NGS5 318 aa16.9■□□□□ 0.3
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
PLGRKT-201ENST00000223864 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
PLGRKT-201ENST00000223864 ALS2CR12Q96Q35 445 aa16.9■□□□□ 0.3
PLGRKT-201ENST00000223864 TMEM9Q9P0T7 183 aa16.9■□□□□ 0.3
PLGRKT-201ENST00000223864 CACNA1GO43497 2377 aa16.9■□□□□ 0.3
PLGRKT-201ENST00000223864 OR2AG2A6NM03 316 aa16.89■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 NRDCO43847 1150 aa16.89■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 AP2A1O95782 977 aa16.89■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 CCL4P13236 92 aa16.89■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 MPSTP25325 297 aa16.89■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 AKT1P31749 480 aa16.89■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP16.89■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 TMPRSS3P57727 454 aa16.89■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 CCZ1BP86790 482 aa16.89■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 TMEM164Q5U3C3 297 aa16.89■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 TMEM26Q6ZUK4 368 aa16.89■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 GPR155Q7Z3F1 870 aa16.89■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 NCSTNQ92542 709 aa16.89■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 USP7Q93009 1102 aa16.89■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa16.89■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 POT1Q9NUX5 634 aa16.89■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF148Q9UQR1 794 aa16.89■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 IGSF10Q6WRI0 2623 aa16.88■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa16.88■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 FIGNL2A6NMB9 653 aa16.88■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 C9orf172C9J069 976 aa16.88■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 PRAMEF10O60809 474 aa16.88■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 TPH1P17752 444 aa16.88■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 HALP42357 657 aa16.88■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 MAPK9P45984 424 aa16.88■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 DRG2P55039 364 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 CXADRP78310 365 aa16.88■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 TMPRSS15P98073 1019 aa16.88■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 CLN3Q13286 438 aa16.88■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 FNBP1LQ5T0N5 605 aa16.88■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 SNX20Q7Z614 316 aa16.88■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 LINC00523Q86TU6 105 aa16.88■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 C1orf54Q8WWF1 131 aa16.88■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 ULK4Q96C45 1275 aa16.88■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 SGF29Q96ES7 293 aa16.88■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC40A1Q9NP59 571 aa16.88■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 RAB6BQ9NRW1 208 aa16.88■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 CRLS1Q9UJA2 301 aa16.88■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 KLHL33A6NCF5 533 aa16.87■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 MGAT4DA6NG13 374 aa16.87■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 OR52A4PA6NMU1 304 aa16.87■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 ITGALP20701 1170 aa16.87■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 CD82P27701 267 aa16.87■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 CLCA4Q14CN2 919 aa16.87■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 GPR33Q49SQ1 333 aa16.87■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 METRNLQ641Q3 311 aa16.87■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa16.87■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 PLXDC1Q8IUK5 500 aa16.87■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 NXPE1Q8N323 547 aa16.87■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 TRIM58Q8NG06 486 aa16.87■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 HEXDCQ8WVB3 486 aa16.87■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 CXorf40BQ96DE9 158 aa16.87■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 DCUN1D1Q96GG9 259 aa16.87■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 TAAR9Q96RI9 348 aa16.87■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 CPNE5Q9HCH3 593 aa16.87■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 FOXJ2Q9P0K8 574 aa16.87■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 WDR37Q9Y2I8 494 aa16.87■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa16.87■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa16.87■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa16.86■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 A8MU76 341 aa16.86■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 B4E171 279 aa16.86■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 H7C0S8 307 aa16.86■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 IFNB1P01574 187 aa16.86■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 LIPCP11150 499 aa16.86■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 RALBP11234 206 aa16.86■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 MC4RP32245 332 aa16.86■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 FDFT1P37268 417 aa16.86■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 TSPAN7P41732 249 aa16.86■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 SNX1Q13596 522 aa16.86■□□□□ 0.29
PLGRKT-201ENST00000223864 NFE2L1Q14494 772 aa16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms