RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000093061.6

Trim11-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trim11, Length 2,251 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11-201ENSMUST00000093061 Vmn1r49Q9WUF1 310 aa15.38■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Sppl2cA2A6C4 690 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gbp4A4UUI3 631 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Fam151bD3YUE4 279 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Vmn2r57L7N269 863 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 WarsP32921 481 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Agtr2P35374 363 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Inpp1P49442 396 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 InhbcP55104 352 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Foxj1Q61660 421 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Krt73Q6NXH9 539 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 4930503B20RikQ80ZP0 234 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ppp1r15bQ8BFW3 697 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Camk1dQ8BW96 385 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Snrnp27Q8K194 155 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 C1qtnf12Q8R2Z0 308 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Med17Q8VCD5 649 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Olfr1019Q8VGS3 310 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Spred2Q924S7 410 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ggt7Q99JP7 662 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ttc9bQ9D6E4 239 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 P33monoxQ9DBN4 303 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Cyp4f14Q9EP75 524 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Vps35Q9EQH3 796 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gpr63Q9EQQ3 425 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rgs1Q9JL25 209 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Tbk1Q9WUN2 729 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Zdbf2Q5SS00 2493 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Vmn1r3A2AMT7 306 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 P01679 107 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Aldh1a1P24549 501 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Cyp17a1P27786 507 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Tead2P48301 445 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Pdx1P52946 284 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Cpne9Q1RLL3 553 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 BtrcQ3ULA2 605 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gpr17Q6NS65 339 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gjc2Q8BQU6 440 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ccdc32Q8BS39 179 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Kyat1Q8BTY1 424 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 TpbglQ8C013 384 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Stk-ps2Q8C0V7 499 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ccdc90bQ8C3X2 256 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Dclre1cQ8K4J0 705 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Vmn1r79Q8R285 306 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ampd2Q9DBT5 798 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rgs20Q9QZB1 239 aa15.37■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gm12695A2AGB2 545 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Srp72F8VQC1 671 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 LatO54957 242 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Slc22a2O70577 553 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Slc16a1P53986 493 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Taf1cQ6PDZ2 836 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Lrp10Q7TQH7 713 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Samd4bQ80XS6 687 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 ChfrQ810L3 664 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Sfr1Q8BP27 319 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rab36Q8CAM5 267 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Vmn1r205Q8R276 316 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mtfr2Q8VED8 361 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Slc35b2Q91ZN5 431 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 AasdhpptQ9CQF6 309 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Dnaaf1Q9D2H9 634 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Hormad1Q9D5T7 392 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mmp19Q9JHI0 527 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Smpd3Q9JJY3 655 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Epb41l4bQ9JMC8 527 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Nme4Q9WV84 186 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 BC025446A0A087WQT1 134 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 A0A286YCD0 109 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 FgaE9PV24 789 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Inpp5aE9QAS7 422 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gp5O08742 567 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Neurod4O09105 330 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Fzd1O70421 642 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 ClppO88696 272 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 P01636 108 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Svs4P18419 113 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 CryaaP24622 196 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 CremP27699 357 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Vps26aP40336 327 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Wdr5P61965 334 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 WasP70315 520 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 SirpaP97797 513 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mansc4Q3UU94 337 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 H2-Q2Q4KN81 360 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Q6PAC4 1279 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Znf423Q80TS5 1292 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Slc47a1Q8K0H1 567 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Trpv3Q8K424 791 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Smap1Q91VZ6 440 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mapk8Q91Y86 384 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 NlnQ91YP2 704 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 HnrnpabQ99020 285 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ccdc70Q9D9B0 223 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Pld1Q9Z280 1074 aa15.36■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 1110002E22RikE0CYV9 1786 aa15.35■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gm3147A0A0J9YU88 481 aa15.35■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gm10424A0A0J9YVD0 481 aa15.35■□□□□ 0.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Olfr671A0A1B0GSN5 317 aa15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.4 ms