RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 GFERP55789 205 aa21.64■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 COPS2P61201 443 aa21.64■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 DMPKQ09013 629 aa21.64■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 SPA17Q15506 151 aa21.64■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 PID1Q7Z2X4 250 aa21.64■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa21.64■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 DDHD1Q8NEL9 900 aa21.64■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 IPMKQ8NFU5 416 aa21.64■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 BRSK1Q8TDC3 778 aa21.64■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 CTRCQ99895 268 aa21.64■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 GORASP1Q9BQQ3 440 aa21.64■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 GBA3Q9H227 469 aa21.64■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa21.64■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 EFR3BQ9Y2G0 817 aa21.64■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa21.64■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 PDZK1P1A8MUH7 402 aa21.63■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 KCNJ13O60928 360 aa21.63■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 UBXN7O94888 489 aa21.63■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 DLGAP3O95886 979 aa21.63■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 VCLP18206 1134 aa21.63■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 STAT5AP42229 794 aa21.63■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 CAPZBP47756 277 aa21.63■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 GTF2H3Q13889 308 aa21.63■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 MAP7Q14244 749 aa21.63■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 C16orf46Q6P387 395 aa21.63■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 DAAM2Q86T65 1068 aa21.63■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa21.63■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 TRIM48Q8IWZ4 208 aa21.63■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 SLC25A41Q8N5S1 370 aa21.63■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 ESX1Q8N693 406 aa21.63■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 C9orf72Q96LT7 481 aa21.63■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 SLC40A1Q9NP59 571 aa21.63■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 RSPH14Q9UHP6 348 aa21.63■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa21.62■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 F5H423 210 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 GPR39O43194 453 aa21.62■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 IDSP22304 550 aa21.62■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 ITGA9Q13797 1035 aa21.62■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 CHRNA6Q15825 494 aa21.62■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 LDLRAP1Q5SW96 308 aa21.62■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 FAM151BQ6UXP7 276 aa21.62■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa21.62■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 PANX2Q96RD6 677 aa21.62■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 FSD1LQ9BXM9 530 aa21.62■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 APMAPQ9HDC9 416 aa21.62■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 KLHL3Q9UH77 587 aa21.62■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa21.62■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 RCCD1A6NED2 376 aa21.61■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 OR52A4PA6NMU1 304 aa21.61■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 PJA2O43164 708 aa21.61■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 RPL10P27635 214 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 RBL1P28749 1068 aa21.61■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 CA5AP35218 305 aa21.61■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 CTSCP53634 463 aa21.61■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 TCTN3Q6NUS6 607 aa21.61■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 PRSS42Q7Z5A4 293 aa21.61■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 GDAP1Q8TB36 358 aa21.61■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 ACTL9Q8TC94 416 aa21.61■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 HEMGNQ9BXL5 484 aa21.61■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 WDR37Q9Y2I8 494 aa21.61■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 PKP3Q9Y446 797 aa21.61■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 KCNMB2Q9Y691 235 aa21.61■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 ICE1Q9Y2F5 2266 aa21.6■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 BTNL10A8MVZ5 291 aa21.6■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 MKRN2OSH3BPM6 223 aa21.6■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 ANXA9O76027 345 aa21.6■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 NDUFA10O95299 355 aa21.6■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 DRG2P55039 364 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 GEMP55040 296 aa21.6■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 GPR18Q14330 331 aa21.6■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 GPRC6AQ5T6X5 926 aa21.6■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa21.6■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa21.6■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa21.6■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 TEX19Q8NA77 164 aa21.6■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 RSC1A1Q92681 617 aa21.6■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa21.6■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 TTC25Q96NG3 672 aa21.6■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 RAB33BQ9H082 229 aa21.6■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 EPHA6Q9UF33 1036 aa21.6■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa21.6■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa21.6■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 SOWAHDA6NJG2 315 aa21.59■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 H7C0C1 242 aa21.59■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 UGT1A9O60656 530 aa21.59■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 TYRP1P17643 537 aa21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms