RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF487	B1APH4	448 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	RECK	O95980	971 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	MT-ND3	P03897	115 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	PTPN3	P26045	913 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	CHRNA4	P43681	627 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	DMPK	Q09013	629 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	GPS2	Q13227	327 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	NFE2L1	Q14494	772 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	C4orf17	Q53FE4	359 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	LUZP1	Q86V48	1076 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	GDAP1	Q8TB36	358 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	NAT14	Q8WUY8	206 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	UBXN4	Q92575	508 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	PPM1M	Q96MI6	270 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	GLOD4	Q9HC38	313 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	CBX8	Q9HC52	389 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	PDE7B	Q9NP56	450 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	IL26	Q9NPH9	171 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	FGF21	Q9NSA1	209 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	OR5K3	A6NET4	321 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	TLCD2	A6NGC4	264 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	ARGFX	A6NJG6	315 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2AG2	A6NM03	316 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	TTLL8	A6PVC2	850 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338		F5H423	210 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	APOL1	O14791	398 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	UGT1A9	O60656	530 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	SEMA7A	O75326	666 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	AGFG2	O95081	481 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	VCL	P18206	1134 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	UGT1A6	P19224	532 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	UGT1A1	P22309	533 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	UGT1A4	P22310	534 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	PTPN4	P29074	926 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	HMGCL	P35914	325 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	HAL	P42357	657 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	PTGIR	P43119	386 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	PGD	P52209	483 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	DYNLT1	P63172	113 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	GTF2H3	Q13889	308 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	MESD	Q14696	234 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	PLCL1	Q15111	1095 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	PDK1	Q15118	436 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR19	Q15760	415 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	CHRNA6	Q15825	494 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	KDELC1	Q6UW63	502 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	H2AFV	Q71UI9	128 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	AMZ2	Q86W34	360 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	LRBA	P50851	2863 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	VPS4B	O75351	444 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	KRT1	P04264	644 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	NFKB1	P19838	968 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	WNT3A	P56704	352 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	UBASH3A	P57075	661 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	ACY1	Q03154	408 aa		11.66	□□□□□ -0.54

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