RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 DEC1Q9P2X7 70 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 HCN2Q9UL51 889 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD66B4E2M5 251 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 NEMP1O14524 444 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM24O15164 1050 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 MAP3K7O43318 606 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 KERAO60938 352 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 MAPK8P45983 427 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 CCR10P46092 362 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 CSNK1DP48730 415 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 AP1S1P61966 158 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 ARF5P84085 180 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 Q6ZNB5 142 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 SNX32Q86XE0 403 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 STK40Q8N2I9 435 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 DCAF4L2Q8NA75 395 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 STAG3L4Q8TBR4 150 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 AGR3Q8TD06 166 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 TPSD1Q9BZJ3 242 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 VCX3BQ9H321 246 aa25.15■■□□□ 1.62
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CAPNS1-204ENST00000587718 MARK1Q9P0L2 795 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 LRCH1Q9Y2L9 728 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 SPO11Q9Y5K1 396 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 OR51B4Q9Y5P0 310 aa25.15■■□□□ 1.62
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CAPNS1-204ENST00000587718 LOC100653049A0A140TA62 436 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 SYCE1LA8MT33 242 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 CBX4O00257 560 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 NDUFS3O75489 264 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 KRT34O76011 436 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 TMCC1O94876 653 aa25.14■■□□□ 1.62
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CAPNS1-204ENST00000587718 SEMA3AQ14563 771 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 MPP7Q5T2T1 576 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 CLYBLQ8N0X4 340 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 ATOH8Q96SQ7 321 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 RXFP3Q9NSD7 469 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 POMPQ9Y244 141 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 INVSQ9Y283 1065 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 CRYL1Q9Y2S2 319 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAF6Q9Y4K3 522 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 TBC1D3BA6NDS4 549 aa25.14■■□□□ 1.61
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CAPNS1-204ENST00000587718 FZD6O60353 706 aa25.14■■□□□ 1.61
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CAPNS1-204ENST00000587718 STX5Q13190 355 aa25.14■■□□□ 1.61
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CAPNS1-204ENST00000587718 TERB1Q8NA31 727 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4K2Q8NGD2 314 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 LHX3Q9UBR4 397 aa25.14■■□□□ 1.61
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CAPNS1-204ENST00000587718 SPAG17Q6Q759 2223 aa25.13■■□□□ 1.61
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CAPNS1-204ENST00000587718 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 STX16O14662 325 aa25.13■■□□□ 1.61
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CAPNS1-204ENST00000587718 MPLP40238 635 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMD8P48556 350 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 ACADVLP49748 655 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 SGSHP51688 502 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 EOGTQ5NDL2 527 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 HOMEZQ8IX15 550 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 PTERQ96BW5 349 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
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CAPNS1-204ENST00000587718 DSELQ8IZU8 1212 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 LPCAT1Q8NF37 534 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 NRG4Q8WWG1 115 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
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CAPNS1-204ENST00000587718 CATSPER2Q96P56 530 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 FEM1AQ9BSK4 669 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 SMOC1Q9H4F8 434 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 MAGEE1Q9HCI5 957 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 CYP4F12Q9HCS2 524 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 NCOR2Q9Y618 2525 aa25.11■■□□□ 1.61
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