RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 Q6ZSR9 355 aa16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MYO1HQ8N1T3 1032 aa16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TEX37Q96LM6 180 aa16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRIM15Q9C019 465 aa16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UBAP1Q9NZ09 502 aa16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OARD1Q9Y530 152 aa16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRSS21Q9Y6M0 314 aa16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ASPDHA6ND91 283 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AGAP14A8MT82 685 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR7A17O14581 309 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TGM5O43548 720 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPATA31D3P0C874 917 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DGKAP23743 735 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GKP32189 559 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CD70P32970 193 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPM1AP35813 382 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPAM1P38567 509 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GRIA3P42263 894 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PTPN5P54829 565 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UFM1P61960 85 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GTF2H2Q13888 395 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPR33Q49SQ1 333 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LIN52Q52LA3 116 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MACC1Q6ZN28 852 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FIBCD1Q8N539 461 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR2AP1Q8NGE2 309 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM125Q96AQ2 219 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CDK15Q96Q40 435 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CENPKQ9BS16 269 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HTATIP2Q9BUP3 242 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MUC13Q9H3R2 512 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM39AQ9NV64 488 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACTR3BQ9P1U1 418 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MYOFQ9NZM1 2061 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DYTNA2CJ06 578 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GRXCR2A6NFK2 248 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC154A6NI56 674 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CAPN1P07384 714 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BMP1P13497 986 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SERPINA4P29622 427 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CDKL1Q00532 357 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CRY1Q16526 586 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DGKKQ5KSL6 1271 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPRC6AQ5T6X5 926 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GRAMD4Q6IC98 578 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HMBOX1Q6NT76 420 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SCIMPQ6UWF3 145 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TPGS1Q6ZTW0 290 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GALNT4Q8N4A0 578 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM199Q8N511 208 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR4F6Q8NGB9 312 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CANT1Q8WVQ1 401 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VOPP1Q96AW1 172 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LMLNQ96KR4 655 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF597Q96LX8 424 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TSC22D3Q99576 134 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C17orf80Q9BSJ5 609 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZBP1Q9H171 429 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HEBP1Q9NRV9 189 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLK2Q9NYY3 685 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SNX13Q9Y5W8 968 aa16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM234BA2RU67 622 aa16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF839A8K0R7 811 aa16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OTCP00480 354 aa16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NPPAP01160 153 aa16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CTSAP10619 480 aa16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PFKLP17858 780 aa16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WDR5P61964 334 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NFYCQ13952 458 aa16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ERMP1Q7Z2K6 904 aa16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZSWIM9Q86XI8 627 aa16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HS6ST3Q8IZP7 471 aa16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AHI1Q8N157 1196 aa16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANKFN1Q8N957 763 aa16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FNDC5Q8NAU1 212 aa16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TTC16Q8NEE8 873 aa16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 METTL6Q8TCB7 284 aa16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms