RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581180.1

MKS1-210, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 2

Gene MKS1, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-210ENST00000581180 SLC17A6Q9P2U8 582 aa14.87□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 ANKRD12Q6UB98 2062 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 TPP1O14773 563 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 YY2O15391 372 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 SPAG6O75602 509 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 POP7O75817 140 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 GABRB3P28472 473 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 VSNL1P62760 191 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 DMPKQ09013 629 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 SLMAPQ14BN4 828 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 TCEA2Q15560 299 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 UAP1L1Q3KQV9 507 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 CTSL3PQ5NE16 218 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 LVRNQ6Q4G3 990 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 KIAA0408Q6ZU52 694 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 GALNT7Q86SF2 657 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 LRRC6Q86X45 466 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 GKN2Q86XP6 184 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 FUT8Q9BYC5 575 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 UNC13CQ8NB66 2214 aa14.86□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 NEMP2A6NFY4 417 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 MGAT4DA6NG13 374 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 FAM159BA6NKW6 160 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 QSOX1O00391 747 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 PFDN6O15212 129 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 KCNJ13O60928 360 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 HAUS5O94927 633 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 ARHGAP8P85298 464 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 TAF8Q7Z7C8 310 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 AMZ2Q86W34 360 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 OR2L2Q8NH16 312 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 OR4C6Q8NH72 309 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 NETO1Q8TDF5 533 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 KLC4Q9NSK0 619 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 NLGN3Q9NZ94 848 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 TAAR2Q9P1P5 351 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 KCNK6Q9Y257 313 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 BTBD3Q9Y2F9 522 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 CRYL1Q9Y2S2 319 aa14.85□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 KLHL33A6NCF5 533 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 TRIM38O00635 465 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 FFAR2O15552 330 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 FLRT2O43155 660 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 AHSGP02765 367 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 ESR1P03372 595 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 ANXA6P08133 673 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 GSTM1P09488 218 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 OR56A5P0C7T3 313 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 FMO4P31512 558 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 ACTR1BP42025 376 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 GRK6P43250 576 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 ACTR1AP61163 376 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 GSTM4Q03013 218 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 INSCQ1MX18 579 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 DEFB133Q30KQ1 61 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 ZNF549Q6P9A3 640 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 CNSTQ6PJW8 725 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 SLC30A9Q6PML9 568 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 PIP4P1Q86T03 277 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 SLC26A11Q86WA9 606 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 FBF1Q8TES7 1133 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 MCMBPQ9BTE3 642 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 VPS37BQ9H9H4 285 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 ZFATQ9P243 1243 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 GNPTGQ9UJJ9 305 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 RAB21Q9UL25 225 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 PSAT1Q9Y617 370 aa14.84□□□□□ -0.03
MKS1-210ENST00000581180 A6NCN8 305 aa14.83□□□□□ -0.04
MKS1-210ENST00000581180 IQCF5A8MTL0 148 aa14.83□□□□□ -0.04
MKS1-210ENST00000581180 TM4SF5O14894 197 aa14.83□□□□□ -0.04
MKS1-210ENST00000581180 SH3BP5O60239 455 aa14.83□□□□□ -0.04
MKS1-210ENST00000581180 CBFA2T3O75081 653 aa14.83□□□□□ -0.04
MKS1-210ENST00000581180 PIAS1O75925 651 aa14.83□□□□□ -0.04
MKS1-210ENST00000581180 FTH1P02794 183 aa14.83□□□□□ -0.04
MKS1-210ENST00000581180 PKMP14618 531 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
MKS1-210ENST00000581180 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
MKS1-210ENST00000581180 STX2P32856 288 aa14.83□□□□□ -0.04
MKS1-210ENST00000581180 NFE2L1Q14494 772 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms