RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR56A5P0C7T3 313 aa28.03■■■□□ 2.08
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SH3BP2P78314 561 aa28.03■■■□□ 2.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
CTDNEP1-210ENST00000574322 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CDH13P55290 713 aa28.01■■■□□ 2.07
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa28.01■■■□□ 2.07
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CTDNEP1-210ENST00000574322 LONP2Q86WA8 852 aa27.99■■■□□ 2.07
CTDNEP1-210ENST00000574322 AGAP11Q8TF27 550 aa27.99■■■□□ 2.07
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CTDNEP1-210ENST00000574322 DCUN1D1Q96GG9 259 aa27.99■■■□□ 2.07
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