RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574236.5

PHF23-208, Transcript of PHD finger protein 23, humanhuman

TSL 3

Gene PHF23, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23-208ENST00000574236 ITGA9Q13797 1035 aa22.82■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 GPR18Q14330 331 aa22.82■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 NFE2L1Q14494 772 aa22.82■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 PRPSAP1Q14558 356 aa22.82■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 FAM71DQ8N9W8 422 aa22.82■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 RSC1A1Q92681 617 aa22.82■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 RNF31Q96EP0 1072 aa22.82■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 HES6Q96HZ4 224 aa22.82■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 TTC25Q96NG3 672 aa22.82■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 SLC40A1Q9NP59 571 aa22.82■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 PSMD13Q9UNM6 376 aa22.82■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa22.82■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 COL6A6A6NMZ7 2263 aa22.82■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 C5orf60A6NFR6 353 aa22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 STMND1H3BQB6 276 aa22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 SGTAO43765 313 aa22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 PPFIA2O75334 1257 aa22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 SRP72O76094 671 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 STK10O94804 968 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 UBXN7O94888 489 aa22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 C9P02748 559 aa22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 CETN2P41208 172 aa22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 CYP4F2P78329 520 aa22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 DMPKQ09013 629 aa22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 LINC00303Q3SY05 128 aa22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 KCTD11Q693B1 232 aa22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 AMZ2Q86W34 360 aa22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 AVL9Q8NBF6 648 aa22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 RTP4Q96DX8 246 aa22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 SGF29Q96ES7 293 aa22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 WBP1Q96G27 269 aa22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 FERMT1Q9BQL6 677 aa22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 SPRY4Q9C004 299 aa22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 EPB41L1Q9H4G0 881 aa22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 FAM96AQ9H5X1 160 aa22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 ASB8Q9H765 288 aa22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 POT1Q9NUX5 634 aa22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa22.81■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 C2orf81A6NN90 581 aa22.8■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 PPP1CAP62136 330 aa22.8■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 C19orf57Q0VDD7 668 aa22.8■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 FNBP1LQ5T0N5 605 aa22.8■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 SYCE1Q8N0S2 351 aa22.8■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 UBL4BQ8N7F7 174 aa22.8■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.8■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 SLC35B2Q8TB61 432 aa22.8■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 CXorf40BQ96DE9 158 aa22.8■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 C9orf72Q96LT7 481 aa22.8■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 TGM7Q96PF1 710 aa22.8■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 TMEM121Q9BTD3 319 aa22.8■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 ARNT2Q9HBZ2 717 aa22.8■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa22.8■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 LDB2O43679 373 aa22.79■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 AMD1P17707 334 aa22.79■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 TPH1P17752 444 aa22.79■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 VCLP18206 1134 aa22.79■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 MSH3P20585 1137 aa22.79■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 AKT1P31749 480 aa22.79■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 RPE65Q16518 533 aa22.79■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 DCAF12Q5T6F0 453 aa22.79■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 PLXDC1Q8IUK5 500 aa22.79■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 ATG4AQ8WYN0 398 aa22.79■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 AGAP14A8MT82 685 aa22.78■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 RAD1O60671 282 aa22.78■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 PRSS56P0CW18 603 aa22.78■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 PARP6Q2NL67 630 aa22.78■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa22.78■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 EXD3Q8N9H8 876 aa22.78■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 TTC13Q8NBP0 860 aa22.78■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 FBXO8Q9NRD0 319 aa22.78■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 FAM8A1Q9UBU6 413 aa22.78■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 PILRAQ9UKJ1 303 aa22.78■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa22.77■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 KCNJ13O60928 360 aa22.77■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 ANKRD34CP0C6C1 535 aa22.77■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 LIFP15018 202 aa22.77■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 CAPZBP47756 277 aa22.77■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 SEPHS1P49903 392 aa22.77■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 RAB15P59190 212 aa22.77■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 SH3BP2P78314 561 aa22.77■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 METRNLQ641Q3 311 aa22.77■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 EXTL1Q92935 676 aa22.77■■□□□ 1.24
PHF23-208ENST00000574236 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms