RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 SATB1Q01826 763 aa28.69■■■□□ 2.18
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CTDNEP1-208ENST00000573600 C10orf67Q8IYJ2 551 aa28.69■■■□□ 2.18
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CTDNEP1-208ENST00000573600 OARD1Q9Y530 152 aa28.69■■■□□ 2.18
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
CTDNEP1-208ENST00000573600 NUS1Q96E22 293 aa28.66■■■□□ 2.18
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ANTXRLA6NF34 631 aa28.66■■■□□ 2.18
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa28.66■■■□□ 2.18
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CNTN1Q12860 1018 aa28.64■■■□□ 2.18
CTDNEP1-208ENST00000573600 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP28.64■■■□□ 2.182e-8■■■■■ 114
CTDNEP1-208ENST00000573600 AAK1Q2M2I8 961 aa28.64■■■□□ 2.18
CTDNEP1-208ENST00000573600 KIF2BQ8N4N8 673 aa28.64■■■□□ 2.18
CTDNEP1-208ENST00000573600 CEP70Q8NHQ1 597 aa28.64■■■□□ 2.18
CTDNEP1-208ENST00000573600 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
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