RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550208.1

BRF1-216, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 3

Gene BRF1, Length 1,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-216ENST00000550208 RABGEF1Q9UJ41 708 aa22.14■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 FAM169AQ9Y6X4 670 aa22.14■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 CTAGE15A4D2H0 777 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 CASC3O15234 703 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 AP2A2O94973 939 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 TRIM16O95361 564 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 GP1BAP07359 652 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 CTAGE8P0CG41 777 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 F3P13726 295 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 GLB1P16278 677 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 PGAM1P18669 254 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 ELK3P41970 407 aa22.13■■□□□ 1.13
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BRF1-216ENST00000550208 CLDN6P56747 220 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 E2F1Q01094 437 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 DMPKQ09013 629 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 CALCOCO2Q13137 446 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 HIF1AQ16665 826 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 NEPROQ6NW34 567 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 C8orf74Q6P047 294 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 PACS1Q6VY07 963 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 CTAGE6Q86UF2 777 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 CTAGE4Q8IX94 777 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 SFRP1Q8N474 314 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 OR6C4Q8NGE1 309 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 SLC37A2Q8TED4 501 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 NAT6Q93015 286 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 CCDC3Q9BQI4 270 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 FAM8A1Q9UBU6 413 aa22.13■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 RP1P56715 2156 aa22.12■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 PDZK1P1A8MUH7 402 aa22.12■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 NDC80O14777 642 aa22.12■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 PPM1DO15297 605 aa22.12■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 OPA1O60313 960 aa22.12■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 POLBP06746 335 aa22.12■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 CDK4P11802 303 aa22.12■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 BRAFP15056 766 aa22.12■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 PMLP29590 882 aa22.12■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 METRNLQ641Q3 311 aa22.12■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa22.12■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 XKR5Q6UX68 686 aa22.12■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 CFAP206Q8IYR0 622 aa22.12■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 UNC5BQ8IZJ1 945 aa22.12■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 GPR150Q8NGU9 434 aa22.12■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 MAPK15Q8TD08 544 aa22.12■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 WDR37Q9Y2I8 494 aa22.12■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 NDUFS3O75489 264 aa22.11■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 TTPAP49638 278 aa22.11■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 CLCA4Q14CN2 919 aa22.11■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 LONRF1Q17RB8 773 aa22.11■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 AGAP9Q5VTM2 703 aa22.11■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 MRNIPQ6NTE8 343 aa22.11■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 WASH2PQ6VEQ5 465 aa22.11■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 ART4Q93070 314 aa22.11■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 CARD6Q9BX69 1037 aa22.11■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 ABCG4Q9H172 646 aa22.11■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 WASH6PQ9NQA3 447 aa22.11■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 PSMD13Q9UNM6 376 aa22.11■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 WASF3Q9UPY6 502 aa22.11■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 CHMP2BQ9UQN3 213 aa22.11■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 TEX264Q9Y6I9 313 aa22.11■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa22.1■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 A0A0G2JNG1 304 aa22.1■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa22.1■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 OR5K4A6NMS3 321 aa22.1■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 RHPN2P1A8MT19 583 aa22.1■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 KIR2DS3K7RE56 304 aa22.1■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 SLC2A4P14672 509 aa22.1■■□□□ 1.13
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BRF1-216ENST00000550208 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 CENPUQ71F23 418 aa22.1■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 ANKMY2Q8IV38 441 aa22.1■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 CEP112Q8N8E3 955 aa22.1■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 LRRC39Q96DD0 335 aa22.1■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 CFAP36Q96G28 342 aa22.1■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 NAT9Q9BTE0 207 aa22.1■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 PLAC1Q9HBJ0 212 aa22.1■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 ESYT3A0FGR9 886 aa22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 KLHL33A6NCF5 533 aa22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 E7ESA3 106 aa22.09■■□□□ 1.13
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