RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 ATG16L1Q676U5 607 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 TAF8Q7Z7C8 310 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 TRIM74Q86UV6 250 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 NUDCD3Q8IVD9 361 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 CFAP206Q8IYR0 622 aa5.6□□□□□ -1.51
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PTPRO-210ENST00000544244 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
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PTPRO-210ENST00000544244 ACTL7BQ9Y614 415 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 PCNTO95613 3336 aa5.6□□□□□ -1.51
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PTPRO-210ENST00000544244 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
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PTPRO-210ENST00000544244 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
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PTPRO-210ENST00000544244 Q6ZSR6 202 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRO-210ENST00000544244 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRO-210ENST00000544244 PHACTR4Q8IZ21 702 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 CCNYL1Q8N7R7 359 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRO-210ENST00000544244 SGSM3Q96HU1 749 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 OR2M4Q96R27 311 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRO-210ENST00000544244 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 CAB39LQ9H9S4 337 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 ABCF3Q9NUQ8 709 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF358Q9NW07 568 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 SLC17A6Q9P2U8 582 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 EBF1Q9UH73 591 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 SHROOM3Q8TF72 1996 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 WDR91A4D1P6 747 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF839A8K0R7 811 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 METTL12A8MUP2 240 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRO-210ENST00000544244 ACP5P13686 325 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 JUNDP17535 347 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRO-210ENST00000544244 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 CDK3Q00526 305 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRO-210ENST00000544244 ABRQ12979 859 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC153Q494R4 210 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 CLDN19Q8N6F1 224 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 CADM4Q8NFZ8 388 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 OR56A4Q8NGH8 313 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 HM13Q8TCT9 377 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 ARL8AQ96BM9 186 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 APOPT1Q96IL0 206 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 GPR22Q99680 433 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRO-210ENST00000544244 SERGEFQ9UGK8 458 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRO-210ENST00000544244 OR1A2Q9Y585 309 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRO-210ENST00000544244 DOCK8Q8NF50 2099 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRO-210ENST00000544244 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 NIPSNAP2O75323 286 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 ANXA6P08133 673 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 CD38P28907 300 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 GLRBP48167 497 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 CLDN2P57739 230 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 IHHQ14623 411 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 NFATC4Q14934 902 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRO-210ENST00000544244 TSSK4Q6SA08 328 aa5.59□□□□□ -1.51
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