RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 GPSM1Q86YR5 675 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 PLPP6Q8IY26 295 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 CPNE9Q8IYJ1 553 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC26A7Q8TE54 656 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 CDRT15Q96T59 188 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 ASB8Q9H765 288 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR41Q9HAD4 459 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 DEC1Q9P2X7 70 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 DHRS7Q9Y394 339 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 SNX2O60749 519 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 CLDN7O95471 211 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 UGT2B4P06133 528 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 OPRD1P41143 372 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 VASPP50552 380 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP4BP51164 291 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 RUNX3Q13761 415 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 GRAMD4Q6IC98 578 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 RBFAQ8N0V3 343 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 TWIST2Q8WVJ9 160 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 ELSPBP1Q96BH3 223 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa20■□□□□ 0.79
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PACSIN3-211ENST00000539589 IQCF5A8MTL0 148 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 MAP3K7O43318 606 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP6AP2O75787 350 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 BAG2O95816 211 aa20■□□□□ 0.79
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PACSIN3-211ENST00000539589 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 PSMC3P17980 439 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP6V1C1P21283 382 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 GJA4P35212 333 aa20■□□□□ 0.79
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PACSIN3-211ENST00000539589 PTK2BQ14289 1009 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 AGKQ53H12 422 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 GK5Q6ZS86 529 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 AKTIPQ9H8T0 292 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 IL26Q9NPH9 171 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 PPM1HQ9ULR3 514 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 A8MX80 341 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 CRCPO75575 148 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 MLYCDO95822 493 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 ASLP04424 464 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 CTSLP07711 333 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 STX1BP61266 288 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 COL19A1Q14993 1142 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa19.99■□□□□ 0.79
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PACSIN3-211ENST00000539589 C3orf30Q96M34 536 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 RIPOR3Q96MK2 946 aa19.99■□□□□ 0.79
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PACSIN3-211ENST00000539589 PPIL1Q9Y3C6 166 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 CFLARO15519 480 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 ACADSP16219 412 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 FOXA1P55317 472 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 PIGGQ5H8A4 983 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 PYDC1Q8WXC3 89 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 KLHL32Q96NJ5 620 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 LYSMD1Q96S90 227 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC167Q9P0B6 97 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 PIP5K1BO14986 540 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 BPIP17213 487 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 GDI1P31150 447 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 SPAM1P38567 509 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 NNMTP40261 264 aa19.98■□□□□ 0.79
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PACSIN3-211ENST00000539589 PTPN5P54829 565 aa19.98■□□□□ 0.79
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PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC73Q5JTD7 316 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 GDPD4Q6W3E5 623 aa19.98■□□□□ 0.79
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PACSIN3-211ENST00000539589 HMGCLL1Q8TB92 370 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 HEPHQ9BQS7 1158 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 BCAP29Q9UHQ4 241 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 PCTPQ9UKL6 214 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 ATG2BQ96BY7 2078 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 ARNTLO00327 626 aa19.97■□□□□ 0.79
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