RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC1A3P43003 542 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NRIP1P48552 1158 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DGKEP52429 567 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CHRNEQ04844 493 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZP2Q05996 745 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LRRC63Q05C16 580 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SPOCK1Q08629 439 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LSAMPQ13449 338 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SGCBQ16585 318 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PPP1R3AQ16821 1122 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF667Q5HYK9 610 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C6orf183Q5T699 404 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C1orf146Q5VVC0 180 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 METTL21CQ5VZV1 264 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MTSS1LQ765P7 747 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRILQ7L0X0 811 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ADCK2Q7Z695 626 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 VTCN1Q7Z7D3 282 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRIM69Q86WT6 500 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 WFDC8Q8IUA0 241 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NUDCD3Q8IVD9 361 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TIGD4Q8IY51 512 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC15A4Q8N697 577 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DAGLBQ8NCG7 672 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR52N1Q8NH53 320 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF596Q8TC21 504 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DTD1Q8TEA8 209 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PROX1Q92786 737 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 P3H4Q92791 437 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DLG3Q92796 817 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RNFT2Q96EX2 444 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C5orf30Q96GV9 206 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NLNQ9BYT8 704 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RAB17Q9H0T7 212 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC25A18Q9H1K4 315 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 POFUT1Q9H488 388 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DPEP3Q9H4B8 488 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CHRAC1Q9NRG0 131 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TDP1Q9NUW8 608 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MPP6Q9NZW5 540 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 POLLQ9UGP5 575 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CLEC2DQ9UHP7 191 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KCND3Q9UK17 655 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ADAM28Q9UKQ2 775 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FBXW2Q9UKT8 454 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FZD10Q9ULW2 581 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CDC14AQ9UNH5 594 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KCTD3Q9Y597 815 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HEY1Q9Y5J3 304 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UBN2Q6ZU65 1347 aa7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 A0A1B0GVG6 124 aa7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MTMR11A4FU01 709 aa7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CFAP73A6NFT4 308 aa7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 H7C1Q1 480 aa7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FCHO1O14526 889 aa7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF185O15231 689 aa7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 INSIG1O15503 277 aa7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MGRN1O60291 552 aa7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 JAK2O60674 1132 aa7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UGDHO60701 494 aa7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SERPINB7O75635 380 aa7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR6B1O95007 311 aa7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SERPINA6P08185 405 aa7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GNAO1P09471 354 aa7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SPARCP09486 303 aa7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CD3GP09693 182 aa7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM253P0C7T8 217 aa7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ADH5P11766 374 aa7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MYF6P23409 242 aa7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SERPINB1P30740 379 aa7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CD68P34810 354 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GGT5P36269 586 aa7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms