RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529048.5

TSTA3-209, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 869 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-209ENST00000529048 FKBPLQ9UIM3 349 aa13.76□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 KCNK6Q9Y257 313 aa13.76□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 PKP3Q9Y446 797 aa13.76□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 TEX264Q9Y6I9 313 aa13.76□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 AKAP13Q12802 2813 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 TLDC2A0PJX2 215 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 FAM221BA6H8Z2 402 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 AGRPO00253 132 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 EML2O95834 649 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 MT-CO3P00414 261 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 LPOP22079 712 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 STX2P32856 288 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 GRIA1P42261 906 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 LMAN1P49257 510 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 E2F1Q01094 437 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 ILKQ13418 452 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 SEPT6Q14141 434 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 POU6F1Q14863 301 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 LONRF1Q17RB8 773 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 MSS51Q4VC12 460 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 TMPRSS12Q86WS5 348 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 CNPY4Q8N129 248 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 GPR156Q8NFN8 814 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 MDM1Q8TC05 714 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 CAPS2Q9BXY5 557 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 FAM96AQ9H5X1 160 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 ACSS3Q9H6R3 686 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 LRRC40Q9H9A6 602 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 EURLQ9NYK6 297 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 CLCA2Q9UQC9 943 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 ACTL7BQ9Y614 415 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 RNF215Q9Y6U7 377 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 KIF26BQ2KJY2 2108 aa13.75□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 TRABD2BA6NFA1 517 aa13.74□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 SMIM23A6NLE4 172 aa13.74□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 GRID2O43424 1007 aa13.74□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 SNX2O60749 519 aa13.74□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 AP2A1O95782 977 aa13.74□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 HPDP32754 393 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 SLCO1A2P46721 670 aa13.74□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 GPX6P59796 221 aa13.74□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 CCL7P80098 99 aa13.74□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 C14orf28Q4W4Y0 310 aa13.74□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 OGFOD3Q6PK18 319 aa13.74□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa13.74□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 ANKMY2Q8IV38 441 aa13.74□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 PALM2Q8IXS6 379 aa13.74□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa13.74□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 OR52K1Q8NGK4 314 aa13.74□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 TRIM39Q9HCM9 518 aa13.74□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa13.74□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 SLC23A2Q9UGH3 650 aa13.74□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 TPRP12270 2363 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 C2orf81A6NN90 581 aa13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 AP3B1O00203 1094 aa13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 PSMD3O43242 534 aa13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 LDB2O43679 373 aa13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 NUAK1O60285 661 aa13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 CSO75390 466 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 BANF1O75531 89 aa13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 SUN1O94901 812 aa13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 CDK14O94921 469 aa13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 PRAMEF1O95521 474 aa13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 GP1BAP07359 652 aa13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 PRSS56P0CW18 603 aa13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 ELK3P41970 407 aa13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 CAMK2BQ13554 666 aa13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 ST3GAL2Q16842 350 aa13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 LRRC8BQ6P9F7 803 aa13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 ZNF534Q76KX8 674 aa13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 DET1Q7L5Y6 550 aa13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 CCNJLQ8IV13 435 aa13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 NAGSQ8N159 534 aa13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 ARL14Q8N4G2 192 aa13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 BRSK1Q8TDC3 778 aa13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 NAT6Q93015 286 aa13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 CYTH2Q99418 400 aa13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 NAT9Q9BTE0 207 aa13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa13.73□□□□□ -0.21
TSTA3-209ENST00000529048 KLC4Q9NSK0 619 aa13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms