RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 NUBP1P53384 320 aa22.38■■□□□ 1.17
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TSNARE1-208ENST00000524325 CCL4L1Q8NHW4 92 aa22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 ARL8AQ96BM9 186 aa22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAJC28Q9NX36 388 aa22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 KRT37O76014 449 aa22.37■■□□□ 1.17
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TSNARE1-208ENST00000524325 FAM45AQ8TCE6 357 aa22.36■■□□□ 1.17
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TSNARE1-208ENST00000524325 ACSBG2Q5FVE4 666 aa22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 OR2M4Q96R27 311 aa22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 GPAMQ9HCL2 828 aa22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 PCMTD2Q9NV79 361 aa22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
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