RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 LSMEM2Q8N112 164 aa18.36■□□□□ 0.53
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SH3BP2-218ENST00000511185 OR13J1Q8NGT2 312 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 COG1Q8WTW3 980 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF778Q96MU6 729 aa18.36■□□□□ 0.53
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SH3BP2-218ENST00000511185 CASS4Q9NQ75 786 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXJ2Q9P0K8 574 aa18.36■□□□□ 0.53
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SH3BP2-218ENST00000511185 H7C0S8 307 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMD3O43242 534 aa18.35■□□□□ 0.53
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SH3BP2-218ENST00000511185 IDSP22304 550 aa18.35■□□□□ 0.53
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SH3BP2-218ENST00000511185 SNAP47Q5SQN1 464 aa18.35■□□□□ 0.53
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SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF534Q76KX8 674 aa18.35■□□□□ 0.53
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SH3BP2-218ENST00000511185 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
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SH3BP2-218ENST00000511185 OR5K4A6NMS3 321 aa18.34■□□□□ 0.53
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SH3BP2-218ENST00000511185 FOXN2P32314 431 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 PRLHRP49683 370 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 VPS41P49754 854 aa18.34■□□□□ 0.53
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SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF248Q8NDW4 579 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 STYXQ8WUJ0 223 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNE4Q8WWG9 221 aa18.34■□□□□ 0.53
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SH3BP2-218ENST00000511185 COPS8Q99627 209 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 WASH6PQ9NQA3 447 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 POT1Q9NUX5 634 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL3Q9UH77 587 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 JRKLQ9Y4A0 524 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-218ENST00000511185 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
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SH3BP2-218ENST00000511185 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa18.33■□□□□ 0.52
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SH3BP2-218ENST00000511185 TYRP1P17643 537 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMA3P25788 255 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 MSNP26038 577 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
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SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM71Q6P5X7 295 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 GSTA5Q7RTV2 222 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 NCSTNQ92542 709 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 CXorf40BQ96DE9 158 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 C19orf43Q9BQ61 176 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 WWP1Q9H0M0 922 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC40A1Q9NP59 571 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 PYCARDQ9ULZ3 195 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 TCAF1Q9Y4C2 921 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 PRSS21Q9Y6M0 314 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 MGAT4DA6NG13 374 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 A8MU76 341 aa18.32■□□□□ 0.52
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