RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495653.1

PTPN23-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 23, human

TSL 2

Gene PTPN23, Length 676 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN23-205	ENST00000495653	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	DMPK	Q09013	629 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	CLCA4	Q14CN2	919 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	DBN1	Q16643	649 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	BCL7A	Q4VC05	210 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	PHF19	Q5T6S3	580 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	XKR5	Q6UX68	686 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	PIM3	Q86V86	326 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	TMEM74	Q96NL1	305 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	APC2	O95996	2303 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	MGAT4D	A6NG13	374 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	ZW10	O43264	779 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	KCNJ13	O60928	360 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	TMEM63A	O94886	807 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	VIP	P01282	170 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	HGF	P14210	728 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	MPST	P25325	297 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	FNTA	P49354	379 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	PRLHR	P49683	370 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	ACVR1	Q04771	509 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	LAMB3	Q13751	1172 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	PCID2	Q5JVF3	399 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	CPT1B	Q92523	772 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	STRADB	Q9C0K7	418 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	ZMYND15	Q9H091	742 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	SYBU	Q9NX95	663 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	BFAR	Q9NZS9	450 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	DUX1	O43812	170 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	AVIL	O75366	819 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	POLB	P06746	335 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	NMBR	P28336	390 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	HAL	P42357	657 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	MAGEA6	P43360	314 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	NPY2R	P49146	381 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	PRAME	P78395	509 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	GPLD1	P80108	840 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	CDK16	Q00536	496 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	SEMA3A	Q14563	771 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	RPE65	Q16518	533 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	METRNL	Q641Q3	311 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	CES3	Q6UWW8	571 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	CREG2	Q8IUH2	290 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	AVL9	Q8NBF6	648 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	GPR150	Q8NGU9	434 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	OR2L2	Q8NH16	312 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	OR4L1	Q8NH43	312 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	OR10G6	Q8NH81	332 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	IL22	Q9GZX6	179 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	WWP1	Q9H0M0	922 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	POT1	Q9NUX5	634 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPN23-205	ENST00000495653	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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