RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 SEL1L2Q5TEA6 688 aa23.24■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC39A7Q92504 469 aa23.24■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 ZPBPQ9BS86 351 aa23.24■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 FKBPLQ9UIM3 349 aa23.24■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 EFCAB7A8K855 629 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 ANKRD34CP0C6C1 535 aa23.23■■□□□ 1.31
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CTDSP1-211ENST00000492545 CTSCP53634 463 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 XIAPP98170 497 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 MC2RQ01718 297 aa23.23■■□□□ 1.31
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CTDSP1-211ENST00000492545 GPR33Q49SQ1 333 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 MANEAQ5SRI9 462 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 METRNLQ641Q3 311 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF662Q6ZS27 426 aa23.23■■□□□ 1.31
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CTDSP1-211ENST00000492545 FAM129CQ86XR2 697 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 BMPERQ8N8U9 685 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 ART4Q93070 314 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 RTP4Q96DX8 246 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 DCUN1D1Q96GG9 259 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM121Q9BTD3 319 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 FBXO8Q9NRD0 319 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 ACSL5Q9ULC5 683 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 GUCA1BQ9UMX6 200 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
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CTDSP1-211ENST00000492545 MGAT4DA6NG13 374 aa23.22■■□□□ 1.31
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CTDSP1-211ENST00000492545 GPR39O43194 453 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 LDB2O43679 373 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 METTL18O95568 372 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 C9P02748 559 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 ITGALP20701 1170 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 DRG2P55039 364 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 OLIG2Q13516 323 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 SNAP47Q5SQN1 464 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 SNX20Q7Z614 316 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 LINC00523Q86TU6 105 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 OCIAD1Q9NX40 245 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 CRLS1Q9UJA2 301 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 KCTD3Q9Y597 815 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 FASNP49327 2511 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 OR2AG2A6NM03 316 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 OR52A4PA6NMU1 304 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 A8MU76 341 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 CFAP99D6REC4 459 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 EFSO43281 561 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 AP2A1O95782 977 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 ATP1A2P50993 1020 aa23.21■■□□□ 1.31
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CTDSP1-211ENST00000492545 BCL7AQ4VC05 210 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 FNBP1LQ5T0N5 605 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 KLHL35Q6PF15 583 aa23.21■■□□□ 1.31
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CTDSP1-211ENST00000492545 OR13C4Q8NGS5 318 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 OR2L2Q8NH16 312 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 ZFPM2Q8WW38 1151 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 SGF29Q96ES7 293 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 C9orf72Q96LT7 481 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 COPS8Q99627 209 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 RAB33BQ9H082 229 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 WDR70Q9NW82 654 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 EPHA6Q9UF33 1036 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 WDR37Q9Y2I8 494 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 KALRNO60229 2985 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP1-211ENST00000492545 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa23.2■■□□□ 1.3
CTDSP1-211ENST00000492545 H7C0S8 307 aa23.2■■□□□ 1.3
CTDSP1-211ENST00000492545 CA5AP35218 305 aa23.2■■□□□ 1.3
CTDSP1-211ENST00000492545 GPR18Q14330 331 aa23.2■■□□□ 1.3
CTDSP1-211ENST00000492545 RPS6KA1Q15418 735 aa23.2■■□□□ 1.3
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CTDSP1-211ENST00000492545 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
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CTDSP1-211ENST00000492545 ZDHHC12Q96GR4 267 aa23.2■■□□□ 1.3
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CTDSP1-211ENST00000492545 OGFRQ9NZT2 677 aa23.2■■□□□ 1.3
CTDSP1-211ENST00000492545 LIASO43766 372 aa23.19■■□□□ 1.3
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CTDSP1-211ENST00000492545 TYRP1P17643 537 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDSP1-211ENST00000492545 CAPZBP47756 277 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDSP1-211ENST00000492545 GDF10P55107 478 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDSP1-211ENST00000492545 LAMB3Q13751 1172 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDSP1-211ENST00000492545 NFE2L1Q14494 772 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDSP1-211ENST00000492545 OASLQ15646 514 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CTDSP1-211ENST00000492545 RPE65Q16518 533 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDSP1-211ENST00000492545 STYXQ8WUJ0 223 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDSP1-211ENST00000492545 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CTDSP1-211ENST00000492545 ATMQ13315 3056 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDSP1-211ENST00000492545 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa23.18■■□□□ 1.3
CTDSP1-211ENST00000492545 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
CTDSP1-211ENST00000492545 GAS8O95995 478 aa23.18■■□□□ 1.3
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