RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 TRIM4Q9C037 500 aa19.78■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 TUBD1Q9UJT1 453 aa19.78■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa19.78■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 OR2AG2A6NM03 316 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 C2orf81A6NN90 581 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 NKX2-8O15522 239 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 BUD23O43709 281 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 UGT1A9O60656 530 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 NDUFA10O95299 355 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 APOC2P02655 101 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 UGT1A6P19224 532 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 UGT1A1P22309 533 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 UGT1A4P22310 534 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 ARL4DP49703 201 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 COPS2P61201 443 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 ADCY2Q08462 1091 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 SEPT6Q14141 434 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 C16orf46Q6P387 395 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 BBS12Q6ZW61 710 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 PRSS42Q7Z5A4 293 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 TC2NQ8N9U0 490 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 DDHD1Q8NEL9 900 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 ZNF398Q8TD17 642 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 STARD8Q92502 1023 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 RSC1A1Q92681 617 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 ELMO2Q96JJ3 720 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 FICDQ9BVA6 458 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 UGT1A7Q9HAW7 530 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 UGT1A10Q9HAW8 530 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 UGT1A8Q9HAW9 530 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-212ENST00000484841 SUV39H1O43463 412 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 LCA5LO95447 670 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 DLGAP3O95886 979 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 MT-ND3P03897 115 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 LPOP22079 712 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 RBL1P28749 1068 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 DLSTP36957 453 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 STAT5AP42229 794 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 CSRP3P50461 194 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 DMPKQ09013 629 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 GPRC6AQ5T6X5 926 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 C11orf96Q7Z7L8 435 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 PPP1R3BQ86XI6 285 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 UBXN4Q92575 508 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 RAB33BQ9H082 229 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 GBA3Q9H227 469 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 PDE7BQ9NP56 450 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 IL17BQ9UHF5 180 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 PSMD13Q9UNM6 376 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 WDR37Q9Y2I8 494 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 PRAMEF1O95521 474 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 PTMAP06454 111 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 RALBP11234 206 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 FECHP22830 423 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 MARCKSL1P49006 195 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 SH3BP2P78314 561 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 DEFB109BQ30KR1 87 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 FNBP1LQ5T0N5 605 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 ARMC6Q6NXE6 501 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 SARM1Q6SZW1 724 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 KRT35Q92764 455 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 DCUN1D1Q96GG9 259 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 EPHA6Q9UF33 1036 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 TFR2Q9UP52 801 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 KLHL33A6NCF5 533 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 C5orf60A6NFR6 353 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 PRR19A6NJB7 356 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 KATNA1O75449 491 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 KIAA0754O94854 1291 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 CRTAMO95727 393 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 AGTP01019 485 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 CTSCP53634 463 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 PDE1BQ01064 536 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 NFE2L1Q14494 772 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 KRT33BQ14525 404 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 RPE65Q16518 533 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 DET1Q7L5Y6 550 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 GALNT6Q8NCL4 622 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
ACTB-212ENST00000484841 KLHL6Q8WZ60 621 aa19.74■□□□□ 0.75
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