RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 CRADDP78560 199 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 NFE2L1Q14494 772 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 CLCA4Q14CN2 919 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 NKAIN2Q5VXU1 208 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 SLITRK4Q8IW52 837 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 SH3KBP1Q96B97 665 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 CAPZA3Q96KX2 299 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 SLC38A3Q99624 504 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 NUDT22Q9BRQ3 303 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 FOXP3Q9BZS1 431 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 IL22Q9GZX6 179 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 RDH14Q9HBH5 336 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 SAR1BQ9Y6B6 198 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 CTAGE9A4FU28 777 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 BRINP1O60477 761 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 MGAT1P26572 445 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 CCKBRP32239 447 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 PRLHRP49683 370 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 CFHR1Q03591 330 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 METRNLQ641Q3 311 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 PIM3Q86V86 326 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 AVL9Q8NBF6 648 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 OR2L2Q8NH16 312 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 GRK7Q8WTQ7 553 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 TMEM74Q96NL1 305 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 SATB2Q9UPW6 733 aa20.56■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 PMS2P1A4D2B8 440 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 KLHL33A6NCF5 533 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 OR52A4PA6NMU1 304 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 TMEM63AO94886 807 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 VIPP01282 170 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 GABREP78334 506 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 GPLD1P80108 840 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 ITIH4Q14624 930 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 AFTPHQ6ULP2 937 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 OR4L1Q8NH43 312 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 SGSM3Q96HU1 749 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 KIFC1Q9BW19 673 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 SEMA6CQ9H3T2 930 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 UCK1Q9HA47 277 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 EPB41L5Q9HCM4 733 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 TREX1Q9NSU2 369 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 SYBUQ9NX95 663 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 PRSS21Q9Y6M0 314 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 USP24Q9UPU5 2620 aa20.55■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 CCDC187A0A096LP49 1063 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 AVILO75366 819 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 CSF2RBP32927 897 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 SARNPP82979 210 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 MAP9Q49MG5 647 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 C3orf38Q5JPI3 329 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 TMEM26Q6ZUK4 368 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 CLDN19Q8N6F1 224 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 MCUQ8NE86 351 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 OR6P1Q8NGX9 317 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 SLCO2A1Q92959 643 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 POT1Q9NUX5 634 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 PCYOX1Q9UHG3 505 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 PSMD13Q9UNM6 376 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 ACACAQ13085 2346 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 KIF26BQ2KJY2 2108 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa20.53■□□□□ 0.88
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ACTB-211ENST00000480301 LILRA5A6NI73 299 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 DXOO77932 396 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 AP2A2O94973 939 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 NMBRP28336 390 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 NSG1P42857 185 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 PTGIRP43119 386 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 EPHA4P54764 986 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 PRAMEP78395 509 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 SEMA3AQ14563 771 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 RPE65Q16518 533 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 IGF2-ASQ6U949 168 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 TRIM48Q8IWZ4 208 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 CFAP206Q8IYR0 622 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 LSMEM2Q8N112 164 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 NAT8LQ8N9F0 302 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 OR10G6Q8NH81 332 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 STRADBQ9C0K7 418 aa20.53■□□□□ 0.88
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