RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 CLCA4Q14CN2 919 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 FNBP1LQ5T0N5 605 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 POT1Q9NUX5 634 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 OGFRQ9NZT2 677 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF148Q9UQR1 794 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 PSMD3O43242 534 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 SNX1Q13596 522 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 NFE2L1Q14494 772 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 POU6F1Q14863 301 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 SNAP47Q5SQN1 464 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 MICALCLQ6ZW33 695 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 SNX20Q7Z614 316 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 NXPE1Q8N323 547 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 PMEPA1Q969W9 287 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 TLR10Q9BXR5 811 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 B3GNT4Q9C0J1 378 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 FAM96AQ9H5X1 160 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 SLC40A1Q9NP59 571 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 CRLS1Q9UJA2 301 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 SGTAO43765 313 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 IFNB1P01574 187 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 ITGALP20701 1170 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 GPR155Q7Z3F1 870 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 PRUNE1Q86TP1 453 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 TRIM58Q8NG06 486 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 ULK4Q96C45 1275 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 CXorf40BQ96DE9 158 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 ETNK1Q9HBU6 452 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 OCIAD1Q9NX40 245 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 ETS1P14921 441 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 MC4RP32245 332 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 ARSDP51689 593 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 SEPT6Q14141 434 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 GPR18Q14330 331 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 TGIF1Q15583 401 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 BCL7AQ4VC05 210 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 XKR5Q6UX68 686 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 LINC00523Q86TU6 105 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 ZFAND4Q86XD8 727 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 TAAR9Q96RI9 348 aa23.22■■□□□ 1.31
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HOXB3-202ENST00000460160 A8MU76 341 aa23.21■■□□□ 1.31
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HOXB3-202ENST00000460160 TYRP1P17643 537 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 FDFT1P37268 417 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 HALP42357 657 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 ARHGAP40Q5TG30 622 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM164Q5U3C3 297 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 METRNLQ641Q3 311 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 BMPERQ8N8U9 685 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 GLIS1Q8NBF1 620 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 OR52K1Q8NGK4 314 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 ART4Q93070 314 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-202ENST00000460160 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-202ENST00000460160 MGAT4DA6NG13 374 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-202ENST00000460160 MROH6A6NGR9 719 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-202ENST00000460160 EFCAB7A8K855 629 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-202ENST00000460160 PSMA3P25788 255 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-202ENST00000460160 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-202ENST00000460160 GFERP55789 205 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-202ENST00000460160 RPE65Q16518 533 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-202ENST00000460160 CCNG2Q16589 344 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-202ENST00000460160 GPR33Q49SQ1 333 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-202ENST00000460160 FAM129CQ86XR2 697 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-202ENST00000460160 PLXDC1Q8IUK5 500 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-202ENST00000460160 GPR150Q8NGU9 434 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-202ENST00000460160 OR2L2Q8NH16 312 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-202ENST00000460160 STYXQ8WUJ0 223 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-202ENST00000460160 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-202ENST00000460160 DCUN1D1Q96GG9 259 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-202ENST00000460160 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-202ENST00000460160 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-202ENST00000460160 COPS8Q99627 209 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-202ENST00000460160 KLHL3Q9UH77 587 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-202ENST00000460160 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB3-202ENST00000460160 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB3-202ENST00000460160 B4E171 279 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB3-202ENST00000460160 NRDCO43847 1150 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB3-202ENST00000460160 SUN1O94901 812 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB3-202ENST00000460160 C9P02748 559 aa23.19■■□□□ 1.3
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