RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 PDLIM1O00151 329 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 PITPNM1O00562 1244 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 TPST1O60507 370 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 CAPN1P07384 714 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 ALPIP09923 528 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 CTPS1P17812 591 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 FXNQ16595 210 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 ZFAND4Q86XD8 727 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 GPR63Q9BZJ6 419 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 MYRFQ9Y2G1 1151 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 GFRA2O00451 464 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 OR7A17O14581 309 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 ACOX3O15254 700 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 GREM1O60565 184 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF23P17027 643 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 ATP6AP1Q15904 470 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 CYP51A1Q16850 503 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 FUT11Q495W5 492 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 KRT80Q6KB66 452 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 CERS6Q6ZMG9 384 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM150AQ86TG1 271 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 WFDC5Q8TCV5 224 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 IGSF21Q96ID5 467 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 ACTL8Q9H568 366 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 HEBP1Q9NRV9 189 aa15.8■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 INPP4BO15327 924 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 PGLSO95336 258 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 NPPAP01160 153 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 BMP1P13497 986 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 NCK1P16333 377 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 EMX2Q04743 252 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 EP400NLQ6ZTU2 488 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 FIBCD1Q8N539 461 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 DPP10Q8N608 796 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 METTL6Q8TCB7 284 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 MPP4Q96JB8 637 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 CAAP1Q9H8G2 361 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 SUN2Q9UH99 717 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 USP22Q9UPT9 525 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 CEPT1Q9Y6K0 416 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 K7ERQ8 282 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 CSKP41240 450 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 ZXDBP98169 803 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 PRKG2Q13237 762 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 KIAA1841Q6NSI8 718 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 SPRED1Q7Z699 444 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 FAM47BQ8NA70 645 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 OR4F6Q8NGB9 312 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 SCLYQ96I15 445 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 SLC22A12Q96S37 553 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 HAUS8Q9BT25 410 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 CIPCQ9C0C6 399 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 SMOXQ9NWM0 555 aa15.79■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 GRXCR2A6NFK2 248 aa15.78■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 ANKRD28O15084 1053 aa15.78■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 LSM1O15116 133 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP15.78■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 CALRP27797 417 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 HTR1EP28566 365 aa15.78■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 ALDH3B2P48448 385 aa15.78■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 ARMC12Q5T9G4 340 aa15.78■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 SLC2A7Q6PXP3 512 aa15.78■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 IL27RAQ6UWB1 636 aa15.78■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 FRA10AC1Q70Z53 315 aa15.78■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 SERPINA9Q86WD7 417 aa15.78■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 PDPRQ8NCN5 879 aa15.78■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 MYO19Q96H55 970 aa15.78■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 C9orf16Q9BUW7 83 aa15.78■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 BOCQ9BWV1 1114 aa15.78■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 OAZ3Q9UMX2 235 aa15.78■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC160A6NGH7 325 aa15.78■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 H3BSA7 217 aa15.78■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 FFAR2O15552 330 aa15.78■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 LATS1O95835 1130 aa15.78■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 GNAO1P09471 354 aa15.78■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SHQ1-202ENST00000444040 HRH2P25021 359 aa15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms