RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429899.1

ATG4B-211, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-211ENST00000429899 RNF31Q96EP0 1072 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 PDXPQ96GD0 296 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 TEKT5Q96M29 485 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF599Q96NL3 588 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 FMO2Q99518 471 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 SP110Q9HB58 689 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 ATP13A1Q9HD20 1204 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 TMEM9Q9P0T7 183 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 TRHDEQ9UKU6 1024 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 POLHQ9Y253 713 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 MYO7BQ6PIF6 2116 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 NDC80O14777 642 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 KDELR3O43731 214 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 MMP20O60882 483 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 CBX6O95503 412 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 CD160O95971 181 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 FAM153BP0C7A2 387 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 CCNB1P14635 433 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 NFKB1P19838 968 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 TPSB2P20231 275 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 GKP32189 559 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 CSF2RBP32927 897 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 FDFT1P37268 417 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 PGDP52209 483 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 PMS2P54278 862 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 PLTPP55058 493 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 MAZP56270 477 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 SRP54P61011 504 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 BASP1P80723 227 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 CAV1Q03135 178 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 SLC10A7Q0GE19 358 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 ABHD18Q0P651 414 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 CBLBQ13191 982 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 IRF4Q15306 451 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 TPSAB1Q15661 275 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 FAM153CQ494X1 144 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 LRRC73Q5JTD7 316 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 NKAIN2Q5VXU1 208 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 ALG1LQ6GMV1 187 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 EMBQ6PCB8 327 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF534Q76KX8 674 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 PPIL6Q8IXY8 311 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 Q8NA96 180 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 CCL4L1Q8NHW4 92 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 FERMT1Q9BQL6 677 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 TXLNGYQ9BZA5 131 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 PHACTR1Q9C0D0 580 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 MUC3BQ9H195 1237 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 ETNK1Q9HBU6 452 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 SLAMF7Q9NQ25 335 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 FAM153AQ9UHL3 310 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 CCDC88CQ9P219 2028 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 HEATR9A2RTY3 570 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 CDC14CA4D256 554 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 C16orf96A6NNT2 1141 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 B4E171 279 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 SMAPO00193 183 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 NEMP1O14524 444 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 ERLIN1O75477 346 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 JCHAINP01591 159 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 THRAP10827 490 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 TSPAN7P41732 249 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 STAT5AP42229 794 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 MMP13P45452 471 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 LBRQ14739 615 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 PARP6Q2NL67 630 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 KCTD11Q693B1 232 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF438Q7Z4V0 828 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 TMC3Q7Z5M5 1100 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 TAF8Q7Z7C8 310 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 PCGF5Q86SE9 256 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 PGBD5Q8N414 524 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 MREGQ8N565 214 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 TADA1Q96BN2 335 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 AGAP3Q96P47 875 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 FCRL5Q96RD9 977 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 MGME1Q9BQP7 344 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 DPEP2Q9H4A9 486 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 GLOD4Q9HC38 313 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 APMAPQ9HDC9 416 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-211ENST00000429899 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms