RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 PAGE5Q96GU1 130 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 C8orf48Q96LL4 319 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 AK8Q96MA6 479 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 AIFM3Q96NN9 605 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 HAPLN3Q96S86 360 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 PREBQ9HCU5 417 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 PRSS16Q9NQE7 514 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 MYO1AQ9UBC5 1043 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 RWDD2AQ9UIY3 292 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 SVILO95425 2214 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 EFCAB8A8MWE9 144 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 STMND1H3BQB6 276 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 MED24O75448 989 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 OR52Z1P0C646 297 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 RPS7P62081 194 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 MC2RQ01718 297 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 PNOCQ13519 176 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 KCNJ12Q14500 433 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 PTPRRQ15256 657 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 DEFB109BQ30KR1 87 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 POM121L1PQ3SYA9 428 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 FILIP1LQ4L180 1135 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 NUGGCQ68CJ6 796 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 FAM171BQ6P995 826 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 DDI1Q8WTU0 396 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 NRG4Q8WWG1 115 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 WBP2Q969T9 261 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM159Q96B96 161 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 LURAP1Q96LR2 239 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 IL12RB2Q99665 862 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 SYT15Q9BQS2 421 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 MSTO1Q9BUK6 570 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 CALN1Q9BXU9 219 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 SLC2A11Q9BYW1 496 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 ASB7Q9H672 318 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 C17orf75Q9HAS0 396 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 CDH9Q9ULB4 789 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 FZD4Q9ULV1 537 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 L1RE1Q9UN81 338 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 AGAP1Q9UPQ3 857 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF510Q9Y2H8 683 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 SNX9Q9Y5X1 595 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 PLXNA2O75051 1894 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 A0A0B4J269 797 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 VWC2LB2RUY7 222 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 H0YCG3 227 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TLR5O60602 858 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 ATP2C2O75185 946 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 NEBLO76041 1014 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 SUN1O94901 812 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 KIF20AO95235 890 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 CHRM2P08172 466 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 KRT19P08727 400 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 PDGFRBP09619 1106 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 PRKAR1AP10644 381 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 AGXTP21549 392 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 SLC8A1P32418 973 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 SOX5P35711 763 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TUBP50607 506 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 MC1RQ01726 317 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 CST6Q15828 149 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 FLYWCH1Q4VC44 716 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 FCRLBQ6BAA4 426 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TMTC1Q8IUR5 882 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 CNGA4Q8IV77 575 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC13Q8IYE1 715 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TC2NQ8N9U0 490 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 OR6B3Q8NGW1 331 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
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