RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423327.2

SPC24-201, Transcript of SPC24, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SPC24, Length 840 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24-201ENST00000423327 BROXQ5VW32 411 aa15.18■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 ZNF662Q6ZS27 426 aa15.18■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 AMZ2Q86W34 360 aa15.18■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 AGBL5Q8NDL9 886 aa15.18■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 CCDC112Q8NEF3 446 aa15.18■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 C1orf54Q8WWF1 131 aa15.18■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 RSC1A1Q92681 617 aa15.18■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 ART4Q93070 314 aa15.18■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 SGF29Q96ES7 293 aa15.18■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 TTC25Q96NG3 672 aa15.18■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa15.18■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 ZMYND15Q9H091 742 aa15.18■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 LRRC40Q9H9A6 602 aa15.18■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 SLC40A1Q9NP59 571 aa15.18■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 LZTFL1Q9NQ48 299 aa15.18■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa15.18■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa15.18■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 EFCAB7A8K855 629 aa15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 H7C0S8 307 aa15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 VIPP01282 170 aa15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 C9P02748 559 aa15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 ETS1P14921 441 aa15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 TYRP1P17643 537 aa15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 WT1P19544 449 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 AKT1P31749 480 aa15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 VAC14Q08AM6 782 aa15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 POU6F1Q14863 301 aa15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 P3H1Q32P28 736 aa15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 BCL7AQ4VC05 210 aa15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 FNBP1LQ5T0N5 605 aa15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 VASH2Q86V25 355 aa15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 NXPE1Q8N323 547 aa15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 AVL9Q8NBF6 648 aa15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 TAAR9Q96RI9 348 aa15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 C19orf43Q9BQ61 176 aa15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 TLR10Q9BXR5 811 aa15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 B3GNT4Q9C0J1 378 aa15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 KLHL3Q9UH77 587 aa15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 CRLS1Q9UJA2 301 aa15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 PSMD13Q9UNM6 376 aa15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa15.17■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 FASNP49327 2511 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 B4E171 279 aa15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 C1QL1O75973 258 aa15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 UBXN7O94888 489 aa15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 PRB1P04280 392 aa15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 MSH3P20585 1137 aa15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 PSMA3P25788 255 aa15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 MC4RP32245 332 aa15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 TSPAN7P41732 249 aa15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 GRIA1P42261 906 aa15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 PRLHRP49683 370 aa15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 PPP1CAP62136 330 aa15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 PDE1BQ01064 536 aa15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 RPE65Q16518 533 aa15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 LONRF2Q1L5Z9 754 aa15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 ANKS6Q68DC2 871 aa15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 SNX20Q7Z614 316 aa15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 FAM129CQ86XR2 697 aa15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 TRIM48Q8IWZ4 208 aa15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 PIANPQ8IYJ0 282 aa15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 OR52K1Q8NGK4 314 aa15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 TTC9Q92623 222 aa15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 EPB41L1Q9H4G0 881 aa15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 ETNK1Q9HBU6 452 aa15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 APMAPQ9HDC9 416 aa15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 BSNQ9UPA5 3926 aa15.16■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 CCDC78A2IDD5 438 aa15.15■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 MGAT4DA6NG13 374 aa15.15■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 MROH6A6NGR9 719 aa15.15■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 OR51F1A6NGY5 319 aa15.15■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 KCNJ13O60928 360 aa15.15■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 IFNB1P01574 187 aa15.15■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 CCDC175P0C221 793 aa15.15■□□□□ 0.02
SPC24-201ENST00000423327 ANKRD34CP0C6C1 535 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms