RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PNPLA1Q8N8W4 532 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CCDC110Q8TBZ0 833 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PYROXD1Q8WU10 500 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 RSPRY1Q96DX4 576 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TCEAL4Q96EI5 215 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 P2RY11Q96G91 374 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 BTN2A3PQ96KV6 586 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 C9orf72Q96LT7 481 aa6.59□□□□□ -1.35
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CCL20-202ENST00000409189 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
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CCL20-202ENST00000409189 GBA3Q9H227 469 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CENPHQ9H3R5 247 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TRPV5Q9NQA5 729 aa6.59□□□□□ -1.35
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CCL20-202ENST00000409189 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
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CCL20-202ENST00000409189 E9PAM4 449 aa6.58□□□□□ -1.36
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CCL20-202ENST00000409189 SUN1O94901 812 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ABLIM3O94929 683 aa6.58□□□□□ -1.36
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CCL20-202ENST00000409189 LATS1O95835 1130 aa6.58□□□□□ -1.36
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CCL20-202ENST00000409189 APRTP07741 180 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 RHOP08100 348 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 PTPN3P26045 913 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ACRV1P26436 265 aa6.58□□□□□ -1.36
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CCL20-202ENST00000409189 VIPR2P41587 438 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CCR2P41597 374 aa6.58□□□□□ -1.36
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CCL20-202ENST00000409189 ARPP19P56211 112 aa6.58□□□□□ -1.36
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CCL20-202ENST00000409189 AP1B1Q10567 949 aa6.58□□□□□ -1.36
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CCL20-202ENST00000409189 LRRC32Q14392 662 aa6.58□□□□□ -1.36
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CCL20-202ENST00000409189 PARP6Q2NL67 630 aa6.58□□□□□ -1.36
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CCL20-202ENST00000409189 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 C10orf120Q5SQS8 335 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 FAM72AQ5TYM5 149 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 SDHAF4Q5VUM1 108 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 AFMIDQ63HM1 303 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 FAM72DQ6L9T8 149 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ZNF534Q76KX8 674 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ITIH5Q86UX2 942 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 NLRP14Q86W24 1093 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 FAM72BQ86X60 149 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 STKLD1Q8NE28 680 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 FBXO36Q8NEA4 188 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TTC8Q8TAM2 541 aa6.58□□□□□ -1.36
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CCL20-202ENST00000409189 LGMNQ99538 433 aa6.58□□□□□ -1.36
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CCL20-202ENST00000409189 PRORYQ9H606 182 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 C10orf88Q9H8K7 445 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 VPS37BQ9H9H4 285 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 HAUS2Q9NVX0 235 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 OSER1Q9NX31 292 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 GDE1Q9NZC3 331 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 FBN2P35556 2912 aa6.58□□□□□ -1.36
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