RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 GPR33Q49SQ1 333 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 FNBP1LQ5T0N5 605 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 NXPE1Q8N323 547 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 STYXQ8WUJ0 223 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 USP7Q93009 1102 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 ZMYND15Q9H091 742 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC40A1Q9NP59 571 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 CRLS1Q9UJA2 301 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 KLHL33A6NCF5 533 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 C9orf172C9J069 976 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 SGTAO43765 313 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 PRAMEF10O60809 474 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 SUN1O94901 812 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 PSMA3P25788 255 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 MC4RP32245 332 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 HALP42357 657 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 TMPRSS3P57727 454 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 NFE2L1Q14494 772 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 POU6F1Q14863 301 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 BCL7AQ4VC05 210 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM164Q5U3C3 297 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 METRNLQ641Q3 311 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 DET1Q7L5Y6 550 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 HEXDCQ8WVB3 486 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 ATMQ13315 3056 aa20.2■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 MGAT4DA6NG13 374 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 MROH6A6NGR9 719 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 CCL22O00626 93 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 UBXN7O94888 489 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 RALBP11234 206 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 ETS1P14921 441 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 MAPK9P45984 424 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 CXADRP78310 365 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 CDH17Q12864 832 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 SEMA5AQ13591 1074 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 PLXDC1Q8IUK5 500 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 OR52K1Q8NGK4 314 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 OR2L2Q8NH16 312 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 MAIP1Q8WWC4 291 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 CXorf40BQ96DE9 158 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 DCUN1D1Q96GG9 259 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 TAAR9Q96RI9 348 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 COPS8Q99627 209 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM96AQ9H5X1 160 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 OGFRQ9NZT2 677 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 FOXJ2Q9P0K8 574 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 PAK5Q9P286 719 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa20.19■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 FGGP02679 453 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 CD82P27701 267 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 SEPT6Q14141 434 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 GPR155Q7Z3F1 870 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 PRUNE1Q86TP1 453 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC89Q8N998 374 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 GLIS1Q8NBF1 620 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 NAT14Q8WUY8 206 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 RAB6BQ9NRW1 208 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 OCIAD1Q9NX40 245 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 ACSL5Q9ULC5 683 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 PSMD13Q9UNM6 376 aa20.18■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 SDK2Q58EX2 2172 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 B4E171 279 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 CFAP99D6REC4 459 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 E7EVH7 732 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 C9P02748 559 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 LIPCP11150 499 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 TSPAN7P41732 249 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 PRLHRP49683 370 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 GPR18Q14330 331 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 RPE65Q16518 533 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 SKIDA1Q1XH10 827 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 SNAP47Q5SQN1 464 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 XKR5Q6UX68 686 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2E3-201ENST00000392415 SERPINA9Q86WD7 417 aa20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms