RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 SLC36A3Q495N2 470 aa13.04□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC138Q96M89 665 aa13.04□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF599Q96NL3 588 aa13.04□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 HGH1Q9BTY7 390 aa13.04□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 C1orf50Q9BV19 199 aa13.04□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa13.04□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 NACA2Q9H009 215 aa13.04□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 ACTR3BQ9P1U1 418 aa13.04□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 NOX1Q9Y5S8 564 aa13.04□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 GPR45Q9Y5Y3 372 aa13.04□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 PLXNA3P51805 1871 aa13.04□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 FAM92AA1XBS5 289 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 A8MU76 341 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 SYN3O14994 580 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 SNX2O60749 519 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 CES1P23141 567 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 OPRL1P41146 370 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 CYP51A1Q16850 503 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 RABL3Q5HYI8 236 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 FAM26DQ5JW98 314 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 SPATA19Q7Z5L4 167 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 SYVN1Q86TM6 617 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 SNX29P2Q8IUI4 249 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 LPCAT1Q8NF37 534 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 MDGA1Q8NFP4 955 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP13.03□□□□□ -0.325e-10■■■■□ 23.1
TMOD1-202ENST00000375175 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 TEX37Q96LM6 180 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 NSMCE3Q96MG7 304 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 TRIB3Q96RU7 358 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 ACOX2Q99424 681 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 GPR62Q9BZJ7 368 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 KLHL25Q9H0H3 589 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 CRISPLD1Q9H336 500 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 SCUBE2Q9NQ36 999 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM9Q9P0T7 183 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 RIMKLBQ9ULI2 386 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 MED16Q9Y2X0 877 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 A0A1W2PP18 115 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 CLOCKO15516 846 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 VPS26AO75436 327 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 NCK1P16333 377 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 OXTRP30559 389 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 SLC6A4P31645 630 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 GSSP48637 474 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 UFM1P61960 85 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 RING1Q06587 406 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 DUSP4Q13115 394 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 LCN8Q6JVE9 175 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 EFHBQ8N7U6 833 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 CYP2S1Q96SQ9 504 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 CGREF1Q99674 301 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 SLC30A3Q99726 388 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 MGME1Q9BQP7 344 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 MAGEH1Q9H213 219 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 PIF1Q9H611 641 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 BPIFA1Q9NP55 256 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 CD274Q9NZQ7 290 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 ANKRD12Q6UB98 2062 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 MTMR11A4FU01 709 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC154A6NI56 674 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 OR6C75A6NL08 312 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 PFDN6O15212 129 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 INSIG1O15503 277 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 OR1I1O60431 355 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 NIPSNAP2O75323 286 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 SLC22A3O75751 556 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 CKBP12277 381 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 GSK3BP49841 420 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 RPS24P62847 133 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 UGT3A1Q6NUS8 523 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 ARMCX6Q7L4S7 300 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 TTC16Q8NEE8 873 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 OR13F1Q8NGS4 319 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 LINC01599Q8WXQ3 324 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-202ENST00000375175 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms