RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
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TRIM54-201ENST00000296098 CMTM8Q8IZV2 173 aa23.64■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 CLDN19Q8N6F1 224 aa23.64■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 SLC45A3Q96JT2 553 aa23.64■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
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TRIM54-201ENST00000296098 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
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TRIM54-201ENST00000296098 TSPAN33Q86UF1 283 aa23.63■■□□□ 1.37
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TRIM54-201ENST00000296098 HTATIP2Q9BUP3 242 aa23.63■■□□□ 1.37
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TRIM54-201ENST00000296098 RAB26Q9ULW5 256 aa23.63■■□□□ 1.37
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TRIM54-201ENST00000296098 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa23.62■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 A8MX80 341 aa23.62■■□□□ 1.37
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TRIM54-201ENST00000296098 ACRP10323 421 aa23.62■■□□□ 1.37
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TRIM54-201ENST00000296098 GTF2H2Q13888 395 aa23.62■■□□□ 1.37
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TRIM54-201ENST00000296098 C1orf50Q9BV19 199 aa23.62■■□□□ 1.37
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TRIM54-201ENST00000296098 C22orf39Q6P5X5 142 aa23.62■■□□□ 1.37
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TRIM54-201ENST00000296098 OR7A17O14581 309 aa23.61■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 SLC22A3O75751 556 aa23.61■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 CAPN1P07384 714 aa23.61■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 HSD17B1P14061 328 aa23.61■■□□□ 1.37
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TRIM54-201ENST00000296098 LRRC26Q2I0M4 334 aa23.61■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 FUT11Q495W5 492 aa23.61■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 C6orf136Q5SQH8 315 aa23.61■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
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TRIM54-201ENST00000296098 METTL6Q8TCB7 284 aa23.61■■□□□ 1.37
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TRIM54-201ENST00000296098 TEX37Q96LM6 180 aa23.61■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 EFHD1Q9BUP0 239 aa23.61■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 TRIM15Q9C019 465 aa23.61■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
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TRIM54-201ENST00000296098 HS3ST2Q9Y278 367 aa23.61■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 BAIAP3O94812 1187 aa23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 CXCL14O95715 111 aa23.6■■□□□ 1.37
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TRIM54-201ENST00000296098 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
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TRIM54-201ENST00000296098 ASPDHA6ND91 283 aa23.6■■□□□ 1.37
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TRIM54-201ENST00000296098 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 BNIP3LO60238 219 aa23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 EEDO75530 441 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 GUCA1CO95843 209 aa23.6■■□□□ 1.37
TRIM54-201ENST00000296098 HTR6P50406 440 aa23.6■■□□□ 1.37
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