RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268638.9

IRF8-201, Transcript of interferon regulatory factor 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IRF8, Length 3,030 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8-201ENST00000268638 NFYCQ13952 458 aa14.96□□□□□ -0.01
IRF8-201ENST00000268638 CHRNA6Q15825 494 aa14.96□□□□□ -0.01
IRF8-201ENST00000268638 PHKG1Q16816 387 aa14.96□□□□□ -0.01
IRF8-201ENST00000268638 IL27RAQ6UWB1 636 aa14.96□□□□□ -0.01
IRF8-201ENST00000268638 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa14.96□□□□□ -0.01
IRF8-201ENST00000268638 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa14.96□□□□□ -0.01
IRF8-201ENST00000268638 GALNT15Q8N3T1 639 aa14.96□□□□□ -0.01
IRF8-201ENST00000268638 SPG21Q9NZD8 308 aa14.96□□□□□ -0.01
IRF8-201ENST00000268638 GFRA2O00451 464 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 AKAP10O43572 662 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 OR6B1O95007 311 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 TRBC1P01850 177 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 XKR7Q5GH72 579 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 C6orf136Q5SQH8 315 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 RETSATQ6NUM9 610 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 CNKSR3Q6P9H4 555 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 TXNDC11Q6PKC3 985 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 HACD2Q6Y1H2 254 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 SATL1Q86VE3 508 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 OCEL1Q9H607 264 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 AIG1Q9NVV5 245 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 COL4A6Q14031 1691 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 GBF1Q92538 1859 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 FFAR3O14843 346 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 GPR42O15529 346 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 TGM5O43548 720 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 DENRO43583 198 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 PRR35P0CG20 571 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 ETS2P15036 469 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 ATP6V1B1P15313 513 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 CSF2RAP15509 400 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 PSMC3P17980 439 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 ZNF783Q6ZMS7 281 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 MYO1HQ8N1T3 1032 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 SFRP1Q8N474 314 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 OR4F6Q8NGB9 312 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 ELOVL2Q9NXB9 296 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 OGDHLQ9ULD0 1010 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 BBIP1A8MTZ0 92 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 OR7A17O14581 309 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 FFAR2O15552 330 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 MATN4O95460 622 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 OXTRP30559 389 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 SLC7A1P30825 629 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 KCNK10P57789 538 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 AP1S1P61966 158 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 GRM2Q14416 872 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 MARVELD2Q8N4S9 558 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 FIBCD1Q8N539 461 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 HSFX1Q9UBD0 423 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 V9GYQ6 96 aa14.95□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 CHD7Q9P2D1 2997 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 SLC22A3O75751 556 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 MYBPC1Q00872 1141 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 LIN52Q52LA3 116 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 OGFOD2Q6N063 350 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 OR2T34Q8NGX1 318 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 OR2T3Q8NH03 318 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 EGFL8Q99944 293 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 IPPKQ9H8X2 491 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 ABCB8Q9NUT2 735 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 CRLS1Q9UJA2 301 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 CCL26Q9Y258 94 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 A0A1W2PP18 115 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 SAC3D1A6NKF1 404 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 OLFM2O95897 454 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 MT-ND1P03886 318 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 PPP3CCP48454 512 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 ADARP55265 1226 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 RCAN2Q14206 197 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 ABRAXAS2Q15018 415 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 SLC2A7Q6PXP3 512 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 STK40Q8N2I9 435 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 GPR26Q8NDV2 337 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 PBXIP1Q96AQ6 731 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 ABCD2Q9UBJ2 740 aa14.94□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 CCDC154A6NI56 674 aa14.93□□□□□ -0.02
IRF8-201ENST00000268638 SMIM18P0DKX4 95 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms