RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 ARAP2Q8WZ64 1704 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 A0A1B0GUL6 1792 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 SLC28A2O43868 658 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 GPR32O75388 356 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 PIAS1O75925 651 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 EPHX1P07099 455 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF30P17039 623 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 DLG2Q15700 870 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 TRIQKQ629K1 86 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 FAM220AQ7Z4H9 259 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 UBR7Q8N806 425 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 TSGA13Q96PP4 275 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 GULP1Q9UBP9 304 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 NDUFB5O43674 189 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 CDK14O94921 469 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 IFNA16P05015 189 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 CEP78Q5JTW2 689 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 BRAT1Q6PJG6 821 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 SCIMPQ6UWF3 145 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 OR8H2Q8N162 312 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 KBTBD8Q8NFY9 601 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 VPS35Q96QK1 796 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 LPIN3Q9BQK8 851 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 RHBGQ9H310 441 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 NR2E1Q9Y466 385 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 TLL2Q9Y6L7 1015 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-228ENST00000636120 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SH3BGRLO75368 114 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 FABP3P05413 133 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CCL5P13501 91 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ITPKAP23677 461 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 BLVRAP53004 296 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CDH13P55290 713 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CLDN10P78369 228 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 FSTL1Q12841 308 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 LPIN1Q14693 890 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 UPP1Q16831 310 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ALFQ53S48 1182 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SIRPB2Q5JXA9 342 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF781Q8N8C0 355 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TTLQ8NG68 377 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CRYGNQ8WXF5 182 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RNFT2Q96EX2 444 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CEP295NLQ96MC4 621 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 USP29Q9HBJ7 922 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CALML5Q9NZT1 146 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ARL5AQ9Y689 179 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 LRP5O75197 1615 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 NUDT14O95848 222 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 NTRK1P04629 796 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SSR2P43308 183 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PRKAG1P54619 331 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ECT2LQ008S8 904 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SPESP1Q6UW49 350 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 GDPD4Q6W3E5 623 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
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PDE4D-228ENST00000636120 LRRC15Q8TF66 581 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 NUS1Q96E22 293 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 KLHL32Q96NJ5 620 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 MPZL2O60487 215 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 KERAO60938 352 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CFHP08603 1231 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 VIPR1P32241 457 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TMED10P49755 219 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CYP4F8P98187 520 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 C10orf82Q8WW14 230 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 S100ZQ8WXG8 99 aa6.4□□□□□ -1.39
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