RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 MX2P20592 715 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 DCDC1P59894 354 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 IL10RAQ13651 578 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 GTF2H3Q13889 308 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 DPYSL3Q14195 570 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 CHRNA6Q15825 494 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC183Q5T5S1 534 aa26.84■■□□□ 1.89
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CAPNS1-217ENST00000629983 KCTD6Q8NC69 237 aa26.84■■□□□ 1.89
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CAPNS1-217ENST00000629983 FATE1Q969F0 183 aa26.84■■□□□ 1.89
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CAPNS1-217ENST00000629983 SLC41A2Q96JW4 573 aa26.84■■□□□ 1.89
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CAPNS1-217ENST00000629983 RAB33BQ9H082 229 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 THAP2Q9H0W7 228 aa26.83■■□□□ 1.89
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CAPNS1-217ENST00000629983 WASH2PQ6VEQ5 465 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM126BQ8IUX1 230 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF547Q8IVP9 402 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
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CAPNS1-217ENST00000629983 HSD3B7Q9H2F3 369 aa26.82■■□□□ 1.88
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CAPNS1-217ENST00000629983 SCRG1O75711 98 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-217ENST00000629983 COL8A1P27658 744 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-217ENST00000629983 PCSK7Q16549 785 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa26.81■■□□□ 1.88
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CAPNS1-217ENST00000629983 TTC25Q96NG3 672 aa26.8■■□□□ 1.88
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CAPNS1-217ENST00000629983 ARSEP51690 589 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-217ENST00000629983 TMC3Q7Z5M5 1100 aa26.79■■□□□ 1.88
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CAPNS1-217ENST00000629983 CEP41Q9BYV8 373 aa26.79■■□□□ 1.88
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CAPNS1-217ENST00000629983 PSMD13Q9UNM6 376 aa26.79■■□□□ 1.88
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CAPNS1-217ENST00000629983 FAM182AQ5T1J6 154 aa26.78■■□□□ 1.88
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CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF185O15231 689 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-217ENST00000629983 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-217ENST00000629983 HSD11B2P80365 405 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-217ENST00000629983 GPS2Q13227 327 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-217ENST00000629983 PDK2Q15119 407 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR19Q15760 415 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-217ENST00000629983 RHOT1Q8IXI2 618 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIB3Q96RU7 358 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-217ENST00000629983 CD180Q99467 661 aa26.77■■□□□ 1.88
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