RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 POPDC2Q9HBU9 364 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 LMTK2Q8IWU2 1503 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 MAPK12P53778 367 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM62Q0P6H9 643 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CBLBQ13191 982 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SYT16Q17RD7 645 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CHSY3Q70JA7 882 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 LGALS13Q9UHV8 139 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
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PTPRT-209ENST00000612229 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CYB5BO43169 146 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 OR3A3P47888 321 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 OR3A2P47893 321 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 NDUFA9Q16795 377 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 OR4A15Q8NGL6 344 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 KLQ9UEF7 1012 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 FETUBQ9UGM5 382 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PDE10AQ9Y233 779 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 IFT52Q9Y366 437 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SALL1Q9NSC2 1324 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 LMO7Q8WWI1 1683 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 RFXANKO14593 260 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 HSPA12AO43301 675 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CABYRO75952 493 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 AMPD1P23109 780 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 BCL2L1Q07817 233 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PTPN20Q4JDL3 420 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 NIPAL1Q6NVV3 410 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa6.92□□□□□ -1.3
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PTPRT-209ENST00000612229 RGL2O15211 777 aa6.92□□□□□ -1.3
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PTPRT-209ENST00000612229 PCDH8O95206 1070 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SEPHS1P49903 392 aa6.92□□□□□ -1.3
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PTPRT-209ENST00000612229 BRMS1LQ5PSV4 323 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ZPBP2Q6X784 338 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SEC14L1Q92503 715 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ASB7Q9H672 318 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TRPV2Q9Y5S1 764 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ZMPSTE24O75844 475 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 AP2A2O94973 939 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ANGPTL1O95841 491 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TSPAN5P62079 268 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ABRAXAS2Q15018 415 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 OR2L8Q8NGY9 312 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
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PTPRT-209ENST00000612229 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PQ67 120 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD33BA6NCL7 494 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SLC9A3P48764 834 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 NDST1P52848 882 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 MPPE1Q53F39 396 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC58Q96CX6 371 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRA2Q9H9E1 313 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SEC14L3Q9UDX4 400 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CAPN8A6NHC0 703 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 EFCAB9A8MZ26 197 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 MAGEA3P43357 314 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 OR2B6P58173 313 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ARMC12Q5T9G4 340 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 KCTD8Q6ZWB6 473 aa6.92□□□□□ -1.3
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PTPRT-209ENST00000612229 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SNX33Q8WV41 574 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ZFAND2BQ8WV99 257 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 METTL21AQ8WXB1 218 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PANX1Q96RD7 426 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SLC39A3Q9BRY0 314 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 KATNBL1Q9H079 304 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 RIOX1Q9H6W3 641 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CHST7Q9NS84 486 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SLC35F4A4IF30 521 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PDLIM1O00151 329 aa6.92□□□□□ -1.3
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