RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 OR7D4Q8NG98 312 aa11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 GRHL3Q8TE85 626 aa11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 FAR1Q8WVX9 515 aa11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 HSFY1Q96LI6 401 aa11.55□□□□□ -0.56
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HCG18-241ENST00000602290 MIS12Q9H081 205 aa11.55□□□□□ -0.56
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HCG18-241ENST00000602290 ZNF212Q9UDV6 495 aa11.55□□□□□ -0.56
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HCG18-241ENST00000602290 NFS1Q9Y697 457 aa11.55□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
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HCG18-241ENST00000602290 A6NL46 340 aa11.54□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 SPAG6O75602 509 aa11.54□□□□□ -0.56
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HCG18-241ENST00000602290 GLRBP48167 497 aa11.54□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 DNA2P51530 1060 aa11.54□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 PSMD7P51665 324 aa11.54□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 IST1P53990 364 aa11.54□□□□□ -0.56
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HCG18-241ENST00000602290 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
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HCG18-241ENST00000602290 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP11.54□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa11.54□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 RETSATQ6NUM9 610 aa11.54□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 CNNM4Q6P4Q7 775 aa11.54□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 TTC7BQ86TV6 843 aa11.54□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 BIVMQ86UB2 503 aa11.54□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 SLC37A2Q8TED4 501 aa11.54□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 FBF1Q8TES7 1133 aa11.54□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 SEMA4DQ92854 862 aa11.54□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 FAM149B1Q96BN6 582 aa11.54□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 ZSWIM1Q9BR11 485 aa11.54□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 ISCUQ9H1K1 167 aa11.54□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 THAP9Q9H5L6 903 aa11.54□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa11.54□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 SAMD15Q9P1V8 674 aa11.54□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
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HCG18-241ENST00000602290 A0A0U1RQS6 177 aa11.53□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa11.53□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 PJA2O43164 708 aa11.53□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 WIPF1O43516 503 aa11.53□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
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HCG18-241ENST00000602290 OR6C1Q96RD1 312 aa11.53□□□□□ -0.56
HCG18-241ENST00000602290 ENKD1Q9H0I2 346 aa11.53□□□□□ -0.56
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HCG18-241ENST00000602290 RASA4BC9J798 803 aa11.52□□□□□ -0.57
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HCG18-241ENST00000602290 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 SLC2A3P11169 496 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 VDRP11473 427 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 CD19P15391 556 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 GM2AP17900 193 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 RPL13P26373 211 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 CCR1P32246 355 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 TSFMP43897 325 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
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