RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594693.5

ZNF548-204, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF548, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-204ENST00000594693 TEX35Q5T0J7 233 aa17.4■□□□□ 0.38
ZNF548-204ENST00000594693 CRTC3Q6UUV7 619 aa17.4■□□□□ 0.38
ZNF548-204ENST00000594693 CYS1Q717R9 158 aa17.4■□□□□ 0.38
ZNF548-204ENST00000594693 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
ZNF548-204ENST00000594693 GKN2Q86XP6 184 aa17.4■□□□□ 0.38
ZNF548-204ENST00000594693 CILP2Q8IUL8 1156 aa17.4■□□□□ 0.38
ZNF548-204ENST00000594693 RELL1Q8IUW5 271 aa17.4■□□□□ 0.38
ZNF548-204ENST00000594693 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
ZNF548-204ENST00000594693 GSDMCQ9BYG8 508 aa17.4■□□□□ 0.38
ZNF548-204ENST00000594693 TSPYL1Q9H0U9 437 aa17.4■□□□□ 0.38
ZNF548-204ENST00000594693 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
ZNF548-204ENST00000594693 PRSS21Q9Y6M0 314 aa17.4■□□□□ 0.38
ZNF548-204ENST00000594693 PRR19A6NJB7 356 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 OR2AG2A6NM03 316 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 TRIM38O00635 465 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 SLC30A4O14863 429 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 SH3BP5O60239 455 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 KCNJ13O60928 360 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 POP7O75817 140 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 S1PR4O95977 384 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 ANXA6P08133 673 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 ERVK-10P10266 1014 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 PMLP29590 882 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 DET1Q7L5Y6 550 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 TAF8Q7Z7C8 310 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 PIP4P1Q86T03 277 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 KCNMB4Q86W47 210 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 CCDC25Q86WR0 208 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 PALM2Q8IXS6 379 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 CLDN19Q8N6F1 224 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 OR4C6Q8NH72 309 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 CALML6Q8TD86 181 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 NAT14Q8WUY8 206 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 CERS2Q96G23 380 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 TIMM29Q9BSF4 260 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 DUSP23Q9BVJ7 150 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 NLGN3Q9NZ94 848 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 BTBD3Q9Y2F9 522 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 TMEM131Q92545 1883 aa17.39■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 CBFA2T3O75081 653 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 NDUFS3O75489 264 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 GSTA2P09210 222 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 ACP5P13686 325 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 AK4P27144 223 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 GRK6P43250 576 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 PRLHRP49683 370 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 ADARP55265 1226 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 GPX6P59796 221 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 CTBP1Q13363 440 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 TCEA2Q15560 299 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 DEFB133Q30KQ1 61 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 OGFOD3Q6PK18 319 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 CEP128Q6ZU80 1094 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 CNTN4Q8IWV2 1026 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 EID2Q8N6I1 236 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 FAM181AQ8N9Y4 354 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 GSDMBQ8TAX9 411 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 RHBDD1Q8TEB9 315 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 C9orf72Q96LT7 481 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 FMO2Q99518 471 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 FAM167BQ9BTA0 163 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 P2RY12Q9H244 342 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 KLC4Q9NSK0 619 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 TAAR2Q9P1P5 351 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 GULP1Q9UBP9 304 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 FBXO5Q9UKT4 447 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 NFU1Q9UMS0 254 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 LRP4O75096 1905 aa17.38■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa17.37■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa17.37■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 KLHL33A6NCF5 533 aa17.37■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 MGAT4DA6NG13 374 aa17.37■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 PFDN6O15212 129 aa17.37■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 FFAR2O15552 330 aa17.37■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP17.37■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 SSTR1P30872 391 aa17.37■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 DMPKQ09013 629 aa17.37■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 INAVAQ3KP66 663 aa17.37■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF470Q6ECI4 717 aa17.37■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 AMZ2Q86W34 360 aa17.37■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 LRRC6Q86X45 466 aa17.37■□□□□ 0.37
ZNF548-204ENST00000594693 NAXDQ8IW45 347 aa17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms