RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	SUFU	Q9UMX1	484 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772		A0A1B0GTH9	108 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	SLC35F4	A4IF30	521 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772		K7ERQ8	282 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	OR10H2	O60403	315 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	PALM	O75781	387 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	RRM1	P23921	792 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	GCH1	P30793	250 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	PTGER1	P34995	402 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ADH7	P40394	386 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	GNPDA1	P46926	289 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	HILS1	P60008	231 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	HSD11B2	P80365	405 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ADCY2	Q08462	1091 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	NTRK3	Q16288	839 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	IYD	Q6PHW0	289 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	WDR59	Q6PJI9	974 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	CARF	Q8N187	725 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	MDS2	Q8NDY4	140 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ERMN	Q8TAM6	284 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	LINC01560	Q8TB33	94 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ISL2	Q96A47	359 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	VPS50	Q96JG6	964 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	FAM84A	Q96KN4	292 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	INTS13	Q9NVM9	706 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	C2orf81	A6NN90	581 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	POM121C	A8CG34	1229 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	SNPH	O15079	494 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	SIAH2	O43255	324 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	HP	P00738	406 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	HBQ1	P09105	142 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	P4HA1	P13674	534 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	SLC2A4	P14672	509 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF24	P17028	368 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ACVR2A	P27037	513 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	TXK	P42681	527 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	TNNC1	P63316	161 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ELP6	Q0PNE2	266 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	NECTIN1	Q15223	517 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	PSMB7	Q99436	277 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	TEX101	Q9BY14	249 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65

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