RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579843.5

TRIM16-218, Transcript of tripartite motif containing 16, humanhuman

TSL 4

Gene TRIM16, Length 459 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16-218ENST00000579843 HDAC10Q969S8 669 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 PTERQ96BW5 349 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 NUS1Q96E22 293 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 HSFY1Q96LI6 401 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 EPHA6Q9UF33 1036 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 PRKAB1Q9Y478 270 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 ABCA1O95477 2261 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 USF3Q68DE3 2245 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 TSPAN11A1L157 253 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 OR5K4A6NMS3 321 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 NPIPA5E9PKD4 350 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 SMAPO00193 183 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 RHOBTB3O94955 611 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 VIPP01282 170 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 UMODP07911 640 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 ZNF30P17039 623 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 FLT3P36888 993 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 CACNG1Q06432 222 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 OLIG2Q13516 323 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 GSE1Q14687 1217 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 C1orf220Q5T0J3 134 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 AFMIDQ63HM1 303 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 RAET1GQ6H3X3 334 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 TRIM74Q86UV6 250 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 ZNF354CQ86Y25 554 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 CCDC65Q8IXS2 484 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 PAF1Q8N7H5 531 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 AVL9Q8NBF6 648 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 CCDC150Q8NCX0 1101 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 HAS2Q92819 552 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 NCAPGQ9BPX3 1015 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 TRIM62Q9BVG3 475 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 BACH2Q9BYV9 841 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 ADAM19Q9H013 955 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 YY1AP1Q9H869 796 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 POPDC2Q9HBU9 364 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 NPIPA1Q9UND3 350 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 CCDC66A2RUB6 948 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 M0QYV0 167 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 SMPD2O60906 423 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 SRGAP2O75044 1071 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 TMCC1O94876 653 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 FAM157CP0CG43 387 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 MX2P20592 715 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 SLC19A1P41440 591 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 GCLMP48507 274 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 CDK17Q00537 523 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 HSF1Q00613 529 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 NME3Q13232 169 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 TAF5Q15542 800 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 RILPL1Q5EBL4 403 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 BRAT1Q6PJG6 821 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 LCLAT1Q6UWP7 414 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 LRRC31Q6UY01 552 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 USP45Q70EL2 814 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 NLRP8Q86W28 1048 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 KMT5CQ86Y97 462 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 CAMK1DQ8IU85 385 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 TFAP2BQ92481 460 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 RND1Q92730 232 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 EPSTI1Q96J88 318 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 EXOC2Q96KP1 924 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 COQ10AQ96MF6 247 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 RAB33BQ9H082 229 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 CUEDC2Q9H467 287 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 ST7Q9NRC1 585 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRIM16-218ENST00000579843 ZNF212Q9UDV6 495 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms