RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, human

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		32.64	■■■□□ 2.82
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CEACAM1	P13688	526 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ACTR1B	P42025	376 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TTPA	P49638	278 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ACTR1A	P61163	376 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SEMA3A	Q14563	771 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CRYM	Q14894	314 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	INSC	Q1MX18	579 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	32.63	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	LONRF1	Q17RB8	773 aa		32.62	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	BCL7A	Q4VC05	210 aa		32.62	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		32.62	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		32.62	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		32.62	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PROX2	Q3B8N5	592 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GPR150	Q8NGU9	434 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	APOLD1	Q96LR9	279 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	KLC4	Q9NSK0	619 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	KCNK6	Q9Y257	313 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SGTA	O43765	313 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	VCL	P18206	1134 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PRLHR	P49683	370 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CLCNKA	P51800	687 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	NEPRO	Q6NW34	567 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		32.6	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	KCNJ13	O60928	360 aa		32.6	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PML	P29590	882 aa		32.6	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ID4	P47928	161 aa		32.6	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GLRX5	Q86SX6	157 aa		32.6	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	AMZ2	Q86W34	360 aa		32.6	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		32.6	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		32.6	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	NAT14	Q8WUY8	206 aa		32.6	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	GLMN	Q92990	594 aa		32.6	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	KLHL33	A6NCF5	533 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	QSOX1	O00391	747 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TNFSF14	O43557	240 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	AP2A2	O94973	939 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ARL10	Q8N8L6	244 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	PFDN6	O15212	129 aa		32.58	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	OR1I1	O60431	355 aa		32.58	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	KCNK5	O95279	499 aa		32.58	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		32.58	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		32.58	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		32.58	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CALML6	Q8TD86	181 aa		32.58	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	TCF12	Q99081	682 aa		32.58	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		32.58	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		32.58	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		32.58	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		32.58	■■■□□ 2.81
CTDNEP1-209	ENST00000574205	CKMT2	P17540	419 aa		32.57	■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209	ENST00000574205	DMPK	Q09013	629 aa		32.57	■■■□□ 2.8

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