RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC19A1	P41440	591 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	ARSD	P51689	593 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	MAPK10	P53779	464 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	VAC14	Q08AM6	782 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	ITGA9	Q13797	1035 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	TGIF1	Q15583	401 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	KCTD11	Q693B1	232 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	PCSK4	Q6UW60	755 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	21.42	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	21.42	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	C2orf81	A6NN90	581 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200		K7ENP7	123 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	21.41	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	EFS	O43281	561 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	LIPC	P11150	499 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	CTSC	P53634	463 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	DMPK	Q09013	629 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	21.41	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	DTX1	Q86Y01	620 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF398	Q8TD17	642 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	PMEPA1	Q969W9	287 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	AGAP14	A8MT82	685 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	21.4	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNJ13	O60928	360 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	PRAMEF1	O95521	474 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	METTL18	O95568	372 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	CD82	P27701	267 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	21.4	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	GDF10	P55107	478 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	XIAP	P98170	497 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	GTF2H3	Q13889	308 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	SPARCL1	Q14515	664 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	21.4	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	PARP6	Q2NL67	630 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC25	Q96NG3	672 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	TAAR9	Q96RI9	348 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	21.4	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	21.4	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	OGFR	Q9NZT2	677 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	21.4	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		21.39	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	21.39	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	IDS	P22304	550 aa		21.39	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	21.39	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	21.39	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	GSDMD	P57764	484 aa		21.39	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	CLCA4	Q14CN2	919 aa		21.39	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		21.39	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	BMPER	Q8N8U9	685 aa		21.39	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	21.39	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	NCSTN	Q92542	709 aa		21.39	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		21.39	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	21.39	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		21.39	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		21.39	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	21.39	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	21.39	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200		B4E171	279 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	LDB2	O43679	373 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	CRTAM	O95727	393 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	VIP	P01282	170 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	VCL	P18206	1134 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPAN7	P41732	249 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	AMZ2	Q86W34	360 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	RTP4	Q96DX8	246 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	POT1	Q9NUX5	634 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		21.38	■■□□□ 1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	21.38	■■□□□ 1.01

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