RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	ITGAL	P20701	1170 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	CD1C	P29017	333 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	HADHA	P40939	763 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	TERF1	P54274	439 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	GABRE	P78334	506 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	CRADD	P78560	199 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	HHEX	Q03014	270 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	CFHR1	Q03591	330 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	BIRC2	Q13490	618 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	CYP1B1	Q16678	543 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	XKR5	Q6UX68	686 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	SNX20	Q7Z614	316 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	SATB2	Q9UPW6	733 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	RAX	Q9Y2V3	346 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A0G2JNG1	304 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	FANCG	O15287	622 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	KRT14	P02533	472 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	ACRV1	P26436	265 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	FOXN2	P32314	431 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	CSF2RB	P32927	897 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC19A1	P41440	591 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	GPR3	P46089	330 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	INHBC	P55103	352 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	GNG11	P61952	73 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	CACNG1	Q06432	222 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	DMPK	Q09013	629 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	NFE2L1	Q14494	772 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	KIR2DS5	Q14953	304 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	CLCA4	Q14CN2	919 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	MAP9	Q49MG5	647 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	GPR33	Q49SQ1	333 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	C4orf22	Q6V702	233 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF534	Q76KX8	674 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	AMZ2	Q86W34	360 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	HDAC10	Q969S8	669 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	ULK4	Q96C45	1275 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	RANBP9	Q96S59	729 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	HEATR9	A2RTY3	570 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	CES2	O00748	559 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	PHF2	O75151	1096 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	CPNE6	O95741	557 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	GAS8	O95995	478 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC2A4	P14672	509 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	TPSB2	P20231	275 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	IDS	P22304	550 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	ADRA1D	P25100	572 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	CCKBR	P32239	447 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	LSS	P48449	732 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	GPS1	Q13098	491 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	KCNJ11	Q14654	390 aa		11.04	□□□□□ -0.64
TPCN1-223	ENST00000552985	TPSAB1	Q15661	275 aa		11.04	□□□□□ -0.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms