RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533362.1

PUF60-222, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 5

Gene PUF60, Length 616 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-222ENST00000533362 PIANPQ8IYJ0 282 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 AVL9Q8NBF6 648 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 KLC4Q9NSK0 619 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 SIRPGQ9P1W8 387 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 GULP1Q9UBP9 304 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 PCNX2A6NKB5 2137 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 BPTFQ12830 3046 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 OR2AG2A6NM03 316 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 GIPC1O14908 333 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 RFPL3O75679 317 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 TRIM16O95361 564 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 GP1BAP07359 652 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 PMLP29590 882 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 CA5AP35218 305 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 FNBP1LQ5T0N5 605 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 DET1Q7L5Y6 550 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 ZNF547Q8IVP9 402 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 LMNTD2Q8IXW0 634 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 SLC35F3Q8IY50 421 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 PADI4Q9UM07 663 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 KCNK6Q9Y257 313 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 OR5K4A6NMS3 321 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 POP7O75817 140 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 FTH1P19P0C7X4 201 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 IDSP22304 550 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 PRLHRP49683 370 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 ACADVLP49748 655 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 CTSCP53634 463 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 DRG2P55039 364 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 B4GALNT1Q00973 533 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 DMPKQ09013 629 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 BIRC2Q13490 618 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 LONRF1Q17RB8 773 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 C14orf28Q4W4Y0 310 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 CES3Q6UWW8 571 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 CENPUQ71F23 418 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 KYQ8NBH2 561 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 GPR156Q8NFN8 814 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 CALML6Q8TD86 181 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 SGF29Q96ES7 293 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 TCF12Q99081 682 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 TSSK1BQ9BXA7 367 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 ZW10O43264 779 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 FTH1P02794 183 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 OR56A5P0C7T3 313 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 OGNP20774 298 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 DNAJC3Q13217 504 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 SPANXN3Q5MJ09 141 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 ERMP1Q7Z2K6 904 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 C11orf96Q7Z7L8 435 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 GPR150Q8NGU9 434 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 FAM129AQ9BZQ8 928 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 DNAH14Q0VDD8 3507 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 A0A0G2JNG1 304 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 MGAT4DA6NG13 374 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 KIR2DS3K7RE56 304 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 NOBOXO60393 691 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 NDUFS3O75489 264 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 PRSS56P0CW18 603 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 F3P13726 295 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 E2F1Q01094 437 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 KIR2DS5Q14953 304 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 NEPROQ6NW34 567 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 ZNF449Q6P9G9 518 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 LRRC6Q86X45 466 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 OR2L2Q8NH16 312 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 FAM167BQ9BTA0 163 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 FOXP3Q9BZS1 431 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 PHACTR1Q9C0D0 580 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 ST14Q9Y5Y6 855 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 FAM169AQ9Y6X4 670 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa22.07■■□□□ 1.12
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