RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495619.1

NCKAP1-208, Transcript of NCK associated protein 1, human

TSL 3

Gene NCKAP1, Length 665 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCKAP1-208	ENST00000495619	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCKAP1-208	ENST00000495619	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCKAP1-208	ENST00000495619	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCKAP1-208	ENST00000495619	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NCKAP1-208	ENST00000495619	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NCKAP1-208	ENST00000495619	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NCKAP1-208	ENST00000495619	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NCKAP1-208	ENST00000495619	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCKAP1-208	ENST00000495619		A0A0G2JNG1	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	CGA	P01215	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	KRT19	P08727	400 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	PMP22	Q01453	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	KIR2DS5	Q14953	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	STPG4	Q8N801	248 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	SCFD2	Q8WU76	684 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	F2RL3	Q96RI0	385 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	CD4	P01730	458 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	ACADM	P11310	421 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	MEP1A	Q16819	746 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619		Q75L30	129 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	PGAM5	Q96HS1	289 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	SH3BP5	O60239	455 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	AMBP	P02760	352 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	RARG	P13631	454 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	CAMP	P49913	170 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	HILS1	P60008	231 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	CD81	P60033	236 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	RUNX1T1	Q06455	604 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	SMPDL3B	Q92485	455 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	USP6NL	Q92738	828 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	OGFR	Q9NZT2	677 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	NENF	Q9UMX5	172 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	NR3C1	P04150	777 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	LIPF	P07098	398 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	CFC1	P0CG37	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	HRH2	P25021	359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	ACADL	P28330	430 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	ATP12A	P54707	1039 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	WDR38	Q5JTN6	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR2A14	Q96R47	310 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	SETD4	Q9NVD3	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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