RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	CUZD1	Q86UP6	607 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	LCA5	Q86VQ0	697 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	OR4L1	Q8NH43	312 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	CALML6	Q8TD86	181 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	UCMA	Q8WVF2	138 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	EDA	Q92838	391 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	EXT2	Q93063	718 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	PHF21B	Q96EK2	531 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	LMLN	Q96KR4	655 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	NPAS2	Q99743	824 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	GPAM	Q9HCL2	828 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	S100A14	Q9HCY8	104 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	SEPT3	Q9UH03	358 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	MID2	Q9UJV3	735 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF225	Q9UK10	706 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	POMP	Q9Y244	141 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		5.76	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	REV3L	O60673	3130 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A1B0GVM2	712 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	IQCF5	A8MTL0	148 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	AIM2	O14862	343 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	NIPSNAP2	O75323	286 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	CDK14	O94921	469 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	SERPINF2	P08697	491 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	RBP1	P09455	135 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	ALPI	P09923	528 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	SRF	P11831	508 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	CTPS1	P17812	591 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	PFKL	P17858	780 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	ATP6V1C1	P21283	382 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	CD72	P21854	359 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	VHL	P40337	213 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC11A2	P49281	568 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	AGTR2	P50052	363 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	THOP1	P52888	689 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	MTTP	P55157	894 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	PKNOX1	P55347	436 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	PRAME	P78395	509 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	MXRA7	P84157	204 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	ECT2L	Q008S8	904 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	RUNX3	Q13761	415 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	GRB7	Q14451	532 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	HERC3	Q15034	1050 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	SFT2D3	Q587I9	215 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	PIGG	Q5H8A4	983 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	CFAP157	Q5JU67	520 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	LPCAT4	Q643R3	524 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	NXN	Q6DKJ4	435 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		5.75	□□□□□ -1.49
C4BPB-208	ENST00000492730	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		5.75	□□□□□ -1.49

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