RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 FAM153CQ494X1 144 aa8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 STPG1Q5TH74 334 aa8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 SLC30A9Q6PML9 568 aa8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 CEP128Q6ZU80 1094 aa8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 TAF8Q7Z7C8 310 aa8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 LRRTM4Q86VH4 590 aa8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 CILP2Q8IUL8 1156 aa8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF547Q8IVP9 402 aa8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 DENND6AQ8IWF6 608 aa8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 GPR150Q8NGU9 434 aa8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 CALML6Q8TD86 181 aa8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 HEXDCQ8WVB3 486 aa8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 FAM167BQ9BTA0 163 aa8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 TSPYL1Q9H0U9 437 aa8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 VPS37BQ9H9H4 285 aa8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 KLC4Q9NSK0 619 aa8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 FAM8A1Q9UBU6 413 aa8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 KCNK6Q9Y257 313 aa8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 CRYL1Q9Y2S2 319 aa8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 ST14Q9Y5Y6 855 aa8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 PRSS21Q9Y6M0 314 aa8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 LRP4O75096 1905 aa8.71□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 DMXL1Q9Y485 3027 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 NEMP2A6NFY4 417 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 PFDN6O15212 129 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 YY2O15391 372 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 SGTAO43765 313 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 PCDHGA12O60330 932 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 POP7O75817 140 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 PIAS1O75925 651 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 AP2A2O94973 939 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 S1PR4O95977 384 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 ANXA6P08133 673 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 OR56A5P0C7T3 313 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 CD59P13987 128 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 ITGB6P18564 788 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 FMO4P31512 558 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 ACTR1BP42025 376 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 ACTR1AP61163 376 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 VSNL1P62760 191 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 MPP1Q00013 466 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 MGAT5Q09328 741 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 LRP8Q14114 963 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 KYNUQ16719 465 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 TYSND1Q2T9J0 566 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 BCL7AQ4VC05 210 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF789Q5FWF6 425 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 PACS1Q6VY07 963 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 AMZ2Q86W34 360 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 GKN2Q86XP6 184 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 NRROSQ86YC3 692 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 EID2Q8N6I1 236 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 GPBAR1Q8TDU6 330 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 LPGAT1Q92604 370 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 TCF12Q99081 682 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 GSDMCQ9BYG8 508 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 MOCS1Q9NZB8 636 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 NINJ2Q9NZG7 142 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 SIRPGQ9P1W8 387 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 ZFATQ9P243 1243 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 SLC23A2Q9UGH3 650 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 FBXO5Q9UKT4 447 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 GPR34Q9UPC5 381 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 BTBD3Q9Y2F9 522 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa8.7□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF292O60281 2723 aa8.69□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 CACNA1EQ15878 2313 aa8.69□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 IQCF5A8MTL0 148 aa8.69□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 B4DGG1 531 aa8.69□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 LMO7DNF2Z398 122 aa8.69□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 TRIM38O00635 465 aa8.69□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 SH3BP5O60239 455 aa8.69□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 SNX2O60749 519 aa8.69□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 HAUS5O94927 633 aa8.69□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 ACSL3O95573 720 aa8.69□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 GSTA2P09210 222 aa8.69□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 ALPPL2P10696 532 aa8.69□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 VCLP18206 1134 aa8.69□□□□□ -1.02
CASQ1-202ENST00000467691 TNFRSF8P28908 595 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms