RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, human

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP4-208	ENST00000462602	SYT12	Q8IV01	421 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	CEP76	Q8TAP6	659 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	KCNJ9	Q92806	393 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	SGF29	Q96ES7	293 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	BIRC8	Q96P09	236 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	GPR22	Q99680	433 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	GPR27	Q9NS67	375 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	KL	Q9UEF7	1012 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	PRSS38	A1L453	326 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	TMEM202	A6NGA9	273 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	OR2AG2	A6NM03	316 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	OPA1	O60313	960 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	DNAJC6	O75061	913 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	RASGRP1	O95267	797 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	TRIM16	O95361	564 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	TNF	P01375	233 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	MT-ND3	P03897	115 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	CEACAM5	P06731	702 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	VCL	P18206	1134 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	KRT15	P19012	456 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	CRABP2	P29373	138 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	ABCG1	P45844	678 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	CTSC	P53634	463 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	PPARD	Q03181	441 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	TMED2	Q15363	201 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	PARG	Q86W56	976 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	DCLK2	Q8N568	766 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	PIGK	Q92643	395 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	NDN	Q99608	321 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	KCNH6	Q9H252	994 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	TBK1	Q9UHD2	729 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	SUFU	Q9UMX1	484 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	EML5	Q05BV3	1969 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	THADA	Q6YHU6	1953 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	MGAT4D	A6NG13	374 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	DLL1	O00548	723 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	NIPSNAP2	O75323	286 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	WNT1	P04628	370 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	STMN1	P16949	149 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	SAT1	P21673	171 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	FDXR	P22570	491 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	TYK2	P29597	1187 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	GNPDA1	P46926	289 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	SERPINB8	P50452	374 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	NXPH1	P58417	271 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	RAB10	P61026	200 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	BMPR2	Q13873	1038 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	LRP8	Q14114	963 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	FZD2	Q14332	565 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	PYCR3	Q53H96	274 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
SH3BP4-208	ENST00000462602	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		9.25	□□□□□ -0.93

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